Unsere Aufgabe
In der Biodiversitätsinformatik beschäftigen wir uns mit allem, was mit Informationen über das Vorkommen, der Verbreitung und dem Aussehen von Biologischen Organismen zu tun hat.
Hierfür werden Datenmodelle und Tools entwickelt und genutzt um die Aufnahme von Daten, deren Weiterverarbeitung und Nutzung auch in einem weiteren Kontext zu ermöglichen. Ein Schwerpunkt liegt aber auf der Nachhaltigkeit, also der Langzeit-Perspektive für die Daten und der Semantik der Daten, also der Bedeutung. Ziel ist es, die Informationen auch interdisziplinär transparent und wiederverwendbar zur Verfügung zustellen. Wir verpflichten uns der Berlin Declaration on Open Access to Knowledge und streben an alle Informationen nach den FAIR Prinzipien bereit zu stellen.
Unsere Inhalte
- Änderung der Verbreitung von Arten im Laufe der Zeit
- Nischenmodellierung
- Online-Kataloge für Arten
- Zuverlässige taxonomische Kataloge
- Komplexe biologische Wechselwirkungen (z.B. Gesundheit, Ernährungssicherheit, Umweltqualität, nationale Sicherheit)
Schwerpunkte
- Forschung an Biodiversitätsdaten und Open Knowledge
- Digitalisierung von Naturwissenschaftlichen Sammlungen
- Aufbau von Infrastruktur
Kernpunkt der Foschung ist die Strukturierung von "Big Data" und die Darstellung von morphologischen Phenotypen. Dies wird in dem Projekt "eScience-Compliant Standards for Morphology - the MDB Prototype" verfolgt (https://github.com/MorphDBase/MDB-prototype und https://proto.morphdbase.de).
Für die Digitaliserung der Naturwissenschaftlichen Sammlungen wird die Diversity Workbench suite (https://www.diversityworkbench.net) als zentrales Datenverwaltungs-Framework eingesetzt. Die digitalen Sammlungskataloge werden auf dem Hauseigenen Sammlungsportal https://collections.zfmk.de), GBIF und Europeana veröffentlicht. Ganze Datensätze aus z. B. Publikationen werden mit einer eigenen DOI über GFBio veröffentlicht.
Ansprechpartner
Projekte
NFDI4Biodiversity
Leitung: Dr. Peter Grobe
Publikationen
| von
2025/1
FOGS: A SNPSTR Marker Database to Combat Wildlife Trafficking and a Cell Culture Bank for Ex‐Situ Conservation
Molecular Ecology resources
2024/10
The ASV Registry: a place for ASVs to be
Metabarcoding and Metagenomics, 8
2024/9
4 Datenmanagement – 4.3 Management von Vorkommensdaten, Umfang und Herkunft der Datenbestände
2024/5
How dispersal rates depend on the prey capture strategy: A case study of Georgia's spiders
Ecology and Evolution, 5, 14
2023/6
Das FörTax-Datenportal ist online - „Taxonomische Bildungsangebote auf einen Blick“ bundesweit verfügbar
2022/8
Data Flows for Metabarcoding-based Monitoring in the Project Automated Multisensor Stations for Monitoring of Biodiversity
Biodiversity Information Science and Standards, 6
2019/1
SOCCOMAS: a FAIR web content management system that uses knowledge graphs and that is based on semantic programming
2019
2018/12
Using Semantic Programming for Developing a Web Content Management System for Semantic Phenotype Data
2018/5
Using Semantics for morphological Descriptions in Morph•D•Base
2
2018/5
Entry Life-Cycle with automatic Change-History & Provenance Tracking in collaborative Semantic Web Content Management Systems as implemented in SOCCOMAS
2
2017/12
Using taxonomic consistency with semi‐automated data pre‐processing for high quality DNA barcodes
Methods in Ecology and Evolution, 12, 8
2017/8
SOCCOMAS: A Self-Describing and Content-Independent Application for Semantic Ontology-Controlled Web-Content-Management-Systems
1
2017/7
Semantic Annotations of Text and Images in Morph∙D∙Base
1
2017/7
Developing a Module for Generating Formalized Semantic Morphological Descriptions for Morph∙D∙Base
1
2015/6
Phylogenetic significance of chaetal arrangement and chaetogenesis in Maldanidae (Annelida)
3, 134
2015/5
Lessons from the first phase of the German Barcode of Life initiative (2012-2015)
5, 58
2012/12
Fiat or Bona Fide Boundary—A Matter of Granular Perspective
12, 7
2012/1
Accommodating Ontologies to Biological Reality—Top-Level Categories of Cumulative-Constitutively Organized Material Entities
1, 7
2011/4
Top-Level Categories of Constitutively Organized Material Entities - Suggestions for a Formal Top-Level Ontology
4, 6
2025
2024
2023
2022
2019
2018
2017
2015
2012
2011
Mitarbeitende
Christian Bräunig
ztm Biodiversitätsinformatik Wissenschaftlerin / WissenschaftlerE-Mail: c.braeunig@leibniz-lib.de
Christoph Erhardt
ztm Biodiversitätsinformatik Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 228 9122 248
E-Mail: c.erhardt@leibniz-lib.de
Cristina Therese Garilao
ztm Biodiversitätsinformatik Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 40 238317 707
E-Mail: c.garilao@leibniz-lib.de
Dr. Peter Grobe
ztm Biodiversitätsinformatik Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 228 9122 342
E-Mail: p.grobe@leibniz-lib.deDr. Sandra Meid
ztm Biodiversitätsinformatik Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 228 9122 424
E-Mail: s.meid@leibniz-lib.de
Dr. Björn Quast
ztm Biodiversitätsinformatik Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 228 9122 347
E-Mail: b.quast@leibniz-lib.de
Dipl. Biol. Birgit Rach
ztm Biodiversitätsinformatik Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 228 9122 422
E-Mail: b.rach@leibniz-lib.de
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Vermischung von Tierhaltung und Ackerbau, Integration von Blühstreifen und Bäumen, Wasser- und Bodenschutz und vieles mehr: Eine vielfältige Landwirtschaft nutzt nicht nur der Natur, sondern sichert auch uns Menschen die Nahrungsgrundlage und den ...
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Forschung Pressemitteilung WissensvermittlungDatenbank FOGS gegen illegalen Wildtierhandel am Start
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Der globale illegale Wildtierhandel bedroht rund 6.000 geschützte Arten und ihre Populationen. Mit der Referenzdatenbank FOGS und neuen Analysemethoden unterstützt das Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels (LIB) Behörden und ...
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Umilaela Arifin arbeitet am Museum der Natur Hamburg als Herpetologin und hat in ihrer Forscherinnenlaufbahn schon sehr viel erlebt. Nun hat sie sich mit 49 weiteren Fachfrauen aus der Wissenschaft zusammengetan und das Buch „Women in Herpetology“ ...
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Forschung Pressemitteilung„Nicht das Wetter – wir Menschen verursachen das Insektensterben”
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Forschung PressemitteilungMischfruchtanbau bietet Insektenschutz ohne Ertragsverluste
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Wie können wir den drastischen Rückgang der Artenvielfalt stoppen? Eine aktuelle STUDIE unter Federführung des Leibniz-Institutes zur Analyse des Biodiversitätswandels (LIB) zeigt Lösungsmöglichkeiten für Agrarlandschaften. Die Untersuchungen ...
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ForschungDie Auswirkungen des Tiefseebergbaus sind unvorhersehbar
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Bizarr aussehende Lebewesen tummeln sich im diffusen Licht in 200 Metern Meerestiefe und darunter. Dabei wissen wir fast nichts über das Leben in der Tiefsee, unserem größten Ökosystem. Was wir aber wissen: Der Meeresboden beherbergt wertvolle ...
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Die wissenschaftlichen Sammlungen des LIB sind mit ihren 16 Millionen Objekten nun Teil einer globalen Datenbank der weltweit größten Naturkundemuseen. Der digitale Katalog verbindet mehr als eine Milliarden Objekte aus wissenschaftlichen Sammlungen ...
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Forschung PressemitteilungGebietsfremde Landschneckenarten nehmen exponentiell zu
19. Januar 2023
Invasive Landschneckenarten können heimische Arten verdrängen und der menschlichen Gesundheit schaden. Eine aktuelle Studie des Leibniz-Instituts zur Analyse des Biodiversitätswandels (LIB) schafft eine Übersicht über die exponentielle Zunahme und ...
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02. Dezember 2022
Eine Woche vor Beginn der 15. Vertragsstaatenkonferenz zur biologischen Vielfalt (CBD COP15) in Montreal fordert ein Bündnis deutscher Wissenschafts- und Nichtregierungsorganisationen in seiner heute veröffentlichten „FRANKFURTER ERKLÄRUNG“, das ...
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Forschung Museum der Natur Hamburg Museum Koenig Bonn Pressemitteilung SammlungBerliner Erklärung: Für die Zukunft der Menschheit
20. Mai 2022
Dreißig Jahre nach dem ersten Weltnaturgipfel in Rio de Janeiro sind der Verlust der Artenvielfalt und der globale Klimawandel die größten und drängendsten Herausforderungen der Zukunft. Nichts weniger als unsere eigene Existenz steht auf dem Spiel. ...
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ForschungDinos auf den Zahn gefühlt: Was fraßen die Urzeiteidechsen?
10. November 2021
„Die Hamburger Dinos werden eine Schlüsselrolle im Projekt spielen.“ Humboldtstipendiat Emanuel Tschopp will über die Abnutzung und den Wechsel der Zähne mehr über die Lebensweise der Langhalssaurier erfahren. Ein wichtiger Ort seiner ...