Unsere Aufgabe
Die vergleichende Analyse von Genomen und Transkriptomen etabliert sich als ein elementarer Bestandteil der Biodiversitätsforschung. Neue Sequenziertechnologien sowie Entwicklungen von Analysemethoden und Algorithmen ermöglichen es uns Proben aus Sammlungen und der Umwelt, insbesondere von Nichtmodellorganismen, sowie gesamte Populationen zu untersuchen.
Die Sektion Biodiversitätsgenomik am zmb analysiert genomische Daten in einem evolutionären Kontext und versucht damit, phänotypische und genomische Veränderungen zu verknüpfen um Biodiversität besser zu verstehen.
Verknüpfung von Genotyp und Phänotyp
Dr. Astrid Böhne vertritt diese Sektion mit einer herausragenden Expertise in den Bereichen de novo Sequenzierung und Assemblierung sowie vergleichender genomweiter Analysen.
Der Fokus dieser Sektion liegt dabei auf der genomischen Architektur von phänotypischen Neuigkeiten und adaptiven Eigenschaften sowie Artbildungsprozessen.
Projekte der Sektion Vergleichende Genomik - Wirbeltiere beschäftigen sich im Detail mit Populationsdynamiken, Artenbildung, Genfluß, Hybridisierung, Adaptation und Konflikten zwischen den Geschlechtern.
Biodiversität
Wir interessieren uns für den Ursprung, die Interaktion und Verteilung von neuen Arten und fokussieren uns dabei insbesondere auf extrem erfolgreiche Tiergruppen die Teil von Artbildungs-Hotspots und (adaptiven) Radiationen sind aber auch invasive und hybridisierende Arten um Treiber und Bedrohungen von Biodiversität genomisch zu verstehen.
Projekte
SynSex - Sexuelle Selektion und Konflikt in Syngnathidae
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
BIGFOOT - BIodiversity decline's Genomic FOOTprint
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
ColLomic
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
ERGA - Der europäische Referenzgenomatlas
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
BGE - Biodiversitätsgenomik Europa
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
Geschlechtschromosomen in Buntbarschen
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
Publikationen
| von
2025/12
Long-read sequencing and genome assembly of natural history collection samples and challenging specimens
Genome Biology, 1, 26
2025/2
ERGA-BGE Reference Genome of Loboptera subterranea: a cave adapted cockroach endemic to the Canary Islands
2025/2
ERGA-BGE genome of Coenonympha oedippus: an IUCN endangered European butterfly species occurring in two ecotypes
2025/2
Investigation of sex determination in African cichlids reveals lack of fixed sex chromosomes in wild populations
Journal of Evolutionary Biology
2025/1
A chromosome-level, haplotype-resolved genome assembly and annotation for the Eurasian minnow (Leuciscidae: Phoxinus phoxinus) provide evidence of haplotype diversity
Gigascience, 14
2025/1
FOGS: A SNPSTR Marker Database to Combat Wildlife Trafficking and a Cell Culture Bank for Ex‐Situ Conservation
Molecular Ecology resources
2025/1
ERGA-BGE genome ofErebia palaricaChapman, 1905: a montane butterfly endemic to North-West Iberia
2025/1
ERGA-BGE genome of the Spanish Moon MothGraellsia isabellaeGraells, 1849: a nocturnal lepidopteran protected by the Habitats Directive
2025/1
ERGA-BGE genome of Stigmatoteuthis arcturi Robson, 1948: the jewelled squid
2025/1
A high-quality reference genome for the Ural Owl (Strix uralensis) enables investigations of cell cultures as a genomic resource for endangered species
2025/1
ERGA-BGE genome of Cheirolophus tagananensis: an IUCN endangered shrub endemic to the Canary Islands
2025/1
ERGA-BGE genome ofAndrosace saussureiDentant, Lavergne, F. C. Boucher & S. Ibanez, a recently described plant from the rooftops of Europe
2025/1
ERGA-BGE genome ofPinctada radiata(Leach, 1814): one of the first Lessepsian migrants
2025/1
ERGA-BGE Reference Genome ofPhyllidia flava(Nudibranchia: Phyllidiidae), a Relict Species Endemic to the Mediterranean Sea
2024/12
The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics
npj Biodiversity, 1, 3
2024/12
Contextualising samples: supporting reference genomes of European biodiversity through sample and associated metadata collection
npj Biodiversity, 1, 3
2024/12
Museomics reveal origins of East African Pleophylla forest chafers and Miocene forest connectivity
Molecular Phylogenetics and Evolution, 201
2024/12
ERGA-BGE Reference Genome of Gluvia dorsalis: An Endemic Sun Spider from Iberian Arid Regions
2024/12
ERGA-BGE Reference Genome of the Striped Field Mouse (Apodemus agrarius), a Widespread and Abundant Species in Central and Eastern Europe
2024/11
ERGA-BGE Reference Genome of the Northern chamois (Rupicapra rupicapra): Europe’s most abundant mountain ungulate
2024/10
Sulawesi stream fish communities depend on connectivity and habitat diversity
Journal of Fish Biology
2024/10
German Barcode of Life, Entdeckung und Beschreibung neuer Arten
2024/10
The ASV Registry: a place for ASVs to be
Metabarcoding and Metagenomics, 8
2024/8
Integrative characterisation of the Northwestern European species of Anacharis Dalman, 1823 (Hymenoptera, Cynipoidea, Figitidae) with the description of three new species
Journal of Hymenoptera Research, 97
2024/8
Exkursion in den Kaukasus: Der CaBOL BioBlitz 2022 in Armenien und Georgien
2025
2024
Mitarbeitende
MSc Aryadevi Anitha Shaji
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / DoktorandTel.: +49 228 9122 407
E-Mail: a.shaji@leibniz-lib.deDr. habil. Astrid Böhne
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 228 9122 365
E-Mail: a.boehne@leibniz-lib.deMSc Nina Casillas
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / DoktorandTel.: +49 228 9122 379
E-Mail: n.casillas@leibniz-lib.deMSc Ioannis Chrysostomakis
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / DoktorandTel.: +49 228 9122 369
E-Mail: i.chrysostomakis@leibniz-lib.deMSc Kevin Hsiung
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / DoktorandTel.: +49 228 9122 369
E-Mail: k.hsiung@leibniz-lib.deSandra Kukowka
zmb Vergleichende Genomik – WirbeltiereTel.: +49 228 9122 343
E-Mail: s.kukowka@leibniz-lib.deDr. Annika Mozer
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / DoktorandTel.: +49 228 9122 355
E-Mail: a.mozer@leibniz-lib.deJan Möhring
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / DoktorandTel.: +49 228 9122 431
E-Mail: j.moehring@leibniz-lib.deMSc Sophie Smith
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / DoktorandTel.: +49 228 9122 369
E-Mail: s.smith@leibniz-lib.deRita Mafalda Soares Monteiro
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Wissenschaftlerin / WissenschaftlerTel.: +49 228 9122 369
E-Mail: r.monteiro@leibniz-lib.de