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Vergleichende Genomik Wirbeltiere, Bonn

Unsere Aufgabe

Die vergleichende Analyse von Genomen und Transkriptomen etabliert sich als ein elementarer Bestandteil der Biodiversitätsforschung. Neue Sequenziertechnologien sowie Entwicklungen von Analysemethoden und Algorithmen ermöglichen es uns Proben aus Sammlungen und der Umwelt, insbesondere von Nichtmodellorganismen, sowie gesamte Populationen zu untersuchen.

Die Sektion Biodiversitätsgenomik am zmb analysiert genomische Daten in einem evolutionären Kontext und versucht damit, phänotypische und genomische Veränderungen zu verknüpfen um Biodiversität besser zu verstehen.

Verknüpfung von Genotyp und Phänotyp

Dr. Astrid Böhne vertritt diese Sektion mit einer herausragenden Expertise in den Bereichen de novo Sequenzierung und Assemblierung sowie vergleichender genomweiter Analysen.
Der Fokus dieser Sektion liegt dabei auf der genomischen Architektur von phänotypischen Neuigkeiten und adaptiven Eigenschaften sowie Artbildungsprozessen.

Projekte der Sektion Vergleichende Genomik - Wirbeltiere beschäftigen sich im Detail mit Populationsdynamiken, Artenbildung, Genfluß, Hybridisierung, Adaptation und Konflikten zwischen den Geschlechtern.

Biodiversität

Wir interessieren uns für den Ursprung, die Interaktion und Verteilung von neuen Arten und fokussieren uns dabei insbesondere auf extrem erfolgreiche Tiergruppen die Teil von Artbildungs-Hotspots und (adaptiven) Radiationen sind aber auch invasive und hybridisierende Arten um Treiber und Bedrohungen von Biodiversität genomisch zu verstehen.

 

Ansprechpartner

Projekte

Publikationen

| von

    2025

  • 2025/12

    Bein, B., Chrysostomakis, I., Arantes, L.S., Brown, T., Gerheim, C., Schell, T., Schneider, C., Leushkin, E., Chen, Z., Sigwart, J., Gonzalez, V., Wong, N.L.W.S., Santos, F.R., Blom, M.P.K., Mayer, F., Mazzoni, C.J., Böhne, A., Winkler, S., Greve, C., Hiller, M.

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    Long-read sequencing and genome assembly of natural history collection samples and challenging specimens

    Genome Biology, 1, 26

  • 2025/2

    López, H., Oromí, P., Belles, X., Ylla, G., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Gut, M., Aguilera, L., Alioto, T., Ferreira, F.C., Gómez-Garrido, J., Cruz, F., Monteiro, R.

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    ERGA-BGE Reference Genome of Loboptera subterranea: a cave adapted cockroach endemic to the Canary Islands

  • 2025/2

    Celik, T., Lokovsek, T., Buzan, E., Böhne, A., Monteiro, R., Fernandez, R., Escudero, N., Gut, M., Aguilera, L., Camara Ferreira, F., Cruz Rodriguez, F., Gomez-Garrido, J., Alioto, T.S., Bortoluzzi, C.

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    ERGA-BGE genome of Coenonympha oedippus: an IUCN endangered European butterfly species occurring in two ecotypes

  • 2025/2

    Smith, S.H., Kukowka, S., Böhne, A.

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    Investigation of sex determination in African cichlids reveals lack of fixed sex chromosomes in wild populations

    Journal of Evolutionary Biology

  • 2025/1

    Oriowo, T.O., Chrysostomakis, I., Martin, S., Kukowka, S., Brown, T., Winkler, S., Myers, E.W., Boehne, A., Stange, M.

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    A chromosome-level, haplotype-resolved genome assembly and annotation for the Eurasian minnow (Leuciscidae: Phoxinus phoxinus) provide evidence of haplotype diversity

    Gigascience, 14

  • 2025/1

    Mozer, A., Di‐Nizo, C.B., Consul, A., Huettel, B., Jäger, R., Akintayo, A., Erhardt, C., Fenner, L., Fischer, D., Forat, S., Gimnich, F., Grobe, P., Martin, S., Nathan, V., Saeed, A., von der Mark, L., Woehle, C., Olek, K., Misof, B., Astrin, J.J.

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    FOGS: A SNPSTR Marker Database to Combat Wildlife Trafficking and a Cell Culture Bank for Ex‐Situ Conservation

    Molecular Ecology resources

  • 2025/1

    Vila, M., Torrado-Blanco, L., Ryrholm, N., Romero-Pedreira, D., Conejero, M., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R., Struck, T.H., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Rodriguez, F.C., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Bortoluzzi, C.

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    ERGA-BGE genome ofErebia palaricaChapman, 1905: a montane butterfly endemic to North-West Iberia

  • 2025/1

    Vila, M., Marí-Mena, N., Vila, R., Riesgo, A., García-Souto, D., Lopez-Vaamonde, C., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R., Struck, T.H., Gut, M., Aguilera, L., Ferreira, F.C., Rodriguez, F.C., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Bortoluzzi, C.

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    ERGA-BGE genome of the Spanish Moon MothGraellsia isabellaeGraells, 1849: a nocturnal lepidopteran protected by the Habitats Directive

  • 2025/1

    Fernandez-Alvarez, F.A., Bernal-Bajo, A., Escudero, N., Conejero, M., Riesgo, A., Fernandez, R., Monteiro, R., Bohne, A., Aguilera, L., Gut, M., Alioto, T.S., Ferreira, F.C., Cruz, F., Gomez-Garrido, J., Brown, T.

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    ERGA-BGE genome of Stigmatoteuthis arcturi Robson, 1948: the jewelled squid

  • 2025/1

    Chrysostomakis, I., Mozer, A., Bruno Di-Nizo, C., Fischer, D., Sargheini, N., von der Mark, L., Huettel, B., Astrin, J.J., Töpfer, T., Böhne, A.

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    A high-quality reference genome for the Ural Owl (Strix uralensis) enables investigations of cell cultures as a genomic resource for endangered species

  • 2025/1

    Pellicer, J., Garnatje, T., Vitales, D., Hidalgo, O., Valles, J., Garcia-Fernandez, A., Santos-Guerra, A., Böhne, A., Monteiro, R., Fernandez, R., Escudero, N., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory Team, ., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations, ., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics Team, ., Thomas, A., Jackson, B., Wood, J.M., Howe, K., Blaxter, M., McCarthy, S., Bortoluzzi, C.

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    ERGA-BGE genome of Cheirolophus tagananensis: an IUCN endangered shrub endemic to the Canary Islands

  • 2025/1

    Lavergne, S., Rosa, A., Peng, C., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T., Oomen, R.A., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Téodori, E., Demirdjian, L., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Brown, T.

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    ERGA-BGE genome ofAndrosace saussureiDentant, Lavergne, F. C. Boucher & S. Ibanez, a recently described plant from the rooftops of Europe

  • 2025/1

    Vasileiadou, K., Manousaki, T., Dailianis, T., Skouradakis, G., Vernadou, E., Karakasi, D., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Istace, B., Couloux, A., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Bortoluzzi, C.

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    ERGA-BGE genome ofPinctada radiata(Leach, 1814): one of the first Lessepsian migrants

  • 2025/1

    Galià-Camps, C., Pontes, M., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., De Panis, D.

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    ERGA-BGE Reference Genome ofPhyllidia flava(Nudibranchia: Phyllidiidae), a Relict Species Endemic to the Mediterranean Sea

  • 2024

  • 2024/12

    Mc Cartney, A.M., Formenti, G., Mouton, A., De Panis, D., Marins, L.S., Leitão, H.G., Diedericks, G., Kirangwa, J., Morselli, M., Salces-Ortiz, J., Escudero, N., Iannucci, A., Natali, C., Svardal, H., Fernández, R., De Pooter, T., Joris, G., Strazisar, M., Wood, J.M.D., Herron, K.E., Seehausen, O., Watts, P.C., Shaw, F., Davey, R.P., Minotto, A., Fernández, J.M., Böhne, A., Alegria, C., Alioto, T., Alves, P.C., Amorim, I.R., Aury, J., Backstrom, N., Baldrian, P., Baltrunaite, L., Barta, E., BedHom, B., Belser, C., Bergsten, J., Bertrand, L., Bilandija, H., Binzer-Panchal, M., Bista, I., Blaxter, M., Borges, P.A.V., Dias, G.B., Bosse, M., Brown, T., Bruggmann, R., Buena-Atienza, E., Burgin, J., Buzan, E., Cariani, A., Casadei, N., Chiara, M., Chozas, S., Čiampor, F., Crottini, A., Cruaud, C., Cruz, F., Dalen, L., De Biase, A., del Campo, J., Delic, T., Dennis, A.B., Derks, M.F.L., Diroma, M.A., Djan, M., Duprat, S., Eleftheriadi, K., Feulner, P.G.D., Flot, J., Forni, G., Fosso, B., Fournier, P., Fournier-Chambrillon, C., Gabaldon, T., Garg, S., Gissi, C., Giupponi, L., Gomez-Garrido, J., González, J., Grilo, M.L., Grüning, B., Guerin, T., Guiglielmoni, N., Gut, M., Haesler, M.P., Hahn, C., Halpern, B., Harrison, P.W., Heintz, J., Hindrikson, M., Höglund, J., Howe, K., Hughes, G.M., Istace, B., Cock, M.J., Janžekovič, F., Jonsson, Z.O., Joye-Dind, S., Koskimäki, J.J., Krystufek, B., Kubacka, J., Kuhl, H., Kusza, S., Labadie, K., Lähteenaro, M., Lantz, H., Lavrinienko, A., Leclère, L., Lopes, R.J., Madsen, O., Magdelenat, G., Magoga, G., Manousaki, T., Mappes, T., Marques, J.P., Redondo, G.I.M., Maumus, F., McCarthy, S.A., Megens, H., Melo-Ferreira, J., Mendes, S.L., Montagna, M., Moreno, J., Mosbech, M., Moura, M., Musilova, Z., Myers, E., Nash, W.J., Nater, A., Nicholson, P., Niell, M., Nijland, R., Noel, B., Noren, K., Oliveira, P.H., Olsen, R., Ometto, L., Oomen, R.A., Ossowski, S., Palinauskas, V., Palsson, S., Panibe, J.P., Pauperio, J., Pavlek, M., Payen, E., Pawlowska, J., Pellicer, J., Pesole, G., Pimenta, J., Pippel, M., Pirttilä, A.M., Poulakakis, N., Rajan, J., M.C. Rego, R., Resendes, R., Resl, P., Riesgo, A., Rodin-Morch, P., Soares, A.E.R., Fernandes, C.R., Romeiras, M.M., Roxo, G., Rüber, L., Ruiz-Lopez, M.J., Saarma, U., da Silva, L.P., Sim-Sim, M., Soler, L., Sousa, V.C., Santos, C.S., Spada, A., Stefanovic, M., Steger, V., Stiller, J., Stöck, M., Struck, T.H., Sudasinghe, H., Tapanainen, R., Tellgren-Roth, C., Trindade, H., Tukalenko, Y., Urso, I., Vacherie, B., Van Belleghem, S.M., Van Oers, K., Vargas-Chavez, C., Velickovic, N., Vella, N., Vella, A., Vernesi, C., Vicente, S., Villa, S., Pettersson, O.V., Volckaert, F.A.M., Voros, J., Wincker, P., Winkler, S., Ciofi, C., Waterhouse, R.M., Mazzoni, C.J.

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    The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics

    npj Biodiversity, 1, 3

  • 2024/12

    Böhne, A., Fernández, R., Leonard, J.A., McCartney, A.M., McTaggart, S., Melo-Ferreira, J., Monteiro, R., Oomen, R.A., Vinnere Pettersson, O., Struck, T.H.

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    Contextualising samples: supporting reference genomes of European biodiversity through sample and associated metadata collection

    npj Biodiversity, 1, 3

  • 2024/12

    Dietz, L., Kukowka, S., Eberle, J., Mayer, C., Niehuis, O., Podsiadlowski, L., Ahrens, D.

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    Museomics reveal origins of East African Pleophylla forest chafers and Miocene forest connectivity

    Molecular Phylogenetics and Evolution, 201

  • 2024/12

    Lozano-Fernandez, J., Domènech, M., Ibos, A., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., De Panis, D.

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    ERGA-BGE Reference Genome of Gluvia dorsalis: An Endemic Sun Spider from Iberian Arid Regions

  • 2024/12

    Janžekovič, F., Buzan, E., Bončina, A., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Haggerty, L., Martin, F., De Panis, D.

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    ERGA-BGE Reference Genome of the Striped Field Mouse (Apodemus agrarius), a Widespread and Abundant Species in Central and Eastern Europe

  • 2024/11

    Buzan, E., Bončina, A., Pokorny, B., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Monteiro, R., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Haggerty, L., Martin, F., De Panis, D.

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    ERGA-BGE Reference Genome of the Northern chamois (Rupicapra rupicapra): Europe’s most abundant mountain ungulate

  • 2024/10

    Wantania, L.L., Koppetsch, T., Möhring, J., Miesen, F.W., Wowor, D., Boneka, F., Herder, F.

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    Sulawesi stream fish communities depend on connectivity and habitat diversity

    Journal of Fish Biology

  • 2024/10

    Peters, R., Rduch, V.

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    German Barcode of Life, Entdeckung und Beschreibung neuer Arten

  • 2024/10

    The ASV Registry: a place for ASVs to be

    Metabarcoding and Metagenomics, 8

  • 2024/8

    Vogel, J., Forshage, M., Bartsch, S.B., Ankermann, A., Mayer, C., Falkenhausen, P.v., Rduch, V., Müller, B., Braun, C., Krammer, H., Peters, R.S.

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    Integrative characterisation of the Northwestern European species of Anacharis Dalman, 1823 (Hymenoptera, Cynipoidea, Figitidae) with the description of three new species

    Journal of Hymenoptera Research, 97

  • 2024/8

    Rduch, V., Dey, L., Ghazaryan, A., Husemann, M., Iankoshvili, G., Krammer, H., Lambrecht, M., Marabuto, E., Mengual, X., Müller, B., Peters, R., Rulik, B., Salden, T., Silva-Brandao, K.L., Espeland, M., Thormann, J., Töpfer, T., Weiss, C., Zyla, D., Hein, N.

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    Exkursion in den Kaukasus: Der CaBOL BioBlitz 2022 in Armenien und Georgien

Mitarbeitende

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