Zum Inhalt springen

Metabarcoding, Bonn

DNA Metabarcoding ermöglicht die Identifikation von tausenden Individuen, oft bis auf Artebene, durch die Sequenzierung  eines kleinen, standardisierten Genfragmentes. Anders als bei der DNA-Barcodierung, wird dies mit der gesamten Artengemeinschaft eines Habitats durchgeführt, um eine schnellere Bewertung der Artenvielfalt zu ermöglichen.

Unsere Forschungsprojekte konzentrieren sich auf:

  • Biomonitoring terrestrischer und aquatischer Ökosysteme
  • Struktur der Artengemeinschaft und Veränderung des Ökosystems
  • Entwicklung von DNA Metabarcoding Methoden
  • Bioinformatik
  • Large scale Laborabläufe
  • Ernährungs- und Darminhaltsanalysen
  • Wirt-Parasit-Interaktionen
  • Mitogenomik und ‘PCR-freie’ Methoden

Wir sind immer auf der Suche nach talentierten und ehrgeizigen Studenten, die mit uns an bestehenden Forschungsprojekten arbeiten möchten.

Ansprechpartner

Dr. Sarah Bourlat

  • Sektionsleiterin Metabarcoding
  • Ombudsperson - Sicherung der Guten wissenschaftlichen Praxis (Vertretung)

Tel.: +49 228 9122 353
E-Mail: s.bourlat@leibniz-lib.de

Projekte

Publikationen

| von

    2025

  • 2025/1

    Leidenberger, S., Wiese, V., Schaumann, F., Pleiss, F., Langen, K., Bourlat, S.J.

    Mehr anzeigen...

    Freshwater mollusc community screening - Classical and eDNA monitoring methods to detect rare, indicator and invasive species

    Science of the Total Environment, 958

  • 2025/1

    Kilian, I.C., Kirse, A., Peters, R.S., Bourlat, S.J., Fonseca, V.G., Wägele, W.J., Hamm, A., Mengual, X.

    Mehr anzeigen...

    Maximizing Identification Precision of Hymenoptera and Brachycera (Diptera) With a Non‐Destructive Metabarcoding Approach

    Ecology and Evolution, 1, 15

  • 2024

  • 2024/12

    Chiavassa, J.A., Kraft, M., Noack, P., Walther, S., Kirse, A., Scherber, C.

    Mehr anzeigen...

    The Field Automatic Insect Recognition‐Device—A Non‐Lethal Semi‐Automatic Malaise Trap for Insect Biodiversity Monitoring: Proof of Concept

    Ecology and Evolution, 12, 14

  • 2024/9

    Kilian, I.C., Neuhoff, D., Täufer, F., Nabel, M., Kirse, A., Bourlat, S.J., Döring, T.

    Mehr anzeigen...

    Der Einfluss von Bewirtschaftung und organischer Düngung auf Bodenarthropoden in ackerbaulich genutzten Böden

    0028-0615, 9-10, 99

  • 2024/8

    BGE Milestone MS 2.4b

  • 2024/7

    Thomas, L.J., Kirse, A., Raus, H., Langen, K., Nümann, B., Tschan, G., Gemeinholzer, B., Wägele, J.W., Bourlat, S.

    Mehr anzeigen...

    Synchronised monitoring of plant and insect diversity: a case study using automated Malaise traps and DNA-based methods

    Biodiversity Data Journal, 12

  • 2024/3

    Chiavassa, J.A., Kraft, M., Noack, P., Walther, S., Kirse, A., Scherber, C.

    Mehr anzeigen...

    The FAIR-Device-a non-lethal and generalist semi-automatic Malaise trap for insect biodiversity monitoring: Proof of concept

    bioRxiv

  • 2024/2

    Hein, N., Astrin, J.J., Beckers, N., Giebner, H., Langen, K., Löffler, J., Misof, B., Fonseca, V.G.

    Mehr anzeigen...

    Arthropod diversity in the alpine tundra using metabarcoding: Spatial and temporal differences in alpha‐ and beta‐diversity

    Ecology and Evolution, 2, 14

  • 2024/2

    Kirse, A., Paja, M., Reinhold, L., Bourlat, S., Wägele, W.

    Mehr anzeigen...

    Development of an automated Malaise trap multisampler

  • 2024/2

    Zizka, V., Langen, K., Kirse, A., Scherges, A., Bourlat, S.J.

    Mehr anzeigen...

    Non-destructive DNA extraction and metabarcoding of arthropod bulk samples: a step-by-step protocol

  • 2023

  • 2023/11

    Bourlat, S.J., Koch, M., Kirse, A., Langen, K., Espeland, M., Giebner, H., Decher, J., Ssymank, A., Fonseca, V.G.

    Mehr anzeigen...

    Metabarcoding dietary analysis in the insectivorous bat Nyctalus leisleri and implications for conservation

    Biodiversity Data Journal, 11

  • 2023/11

    Hörren, T., Bodingbauer, S., Bourlat, S., Grüneberg, C., Kaiser, M., Kiel, E., Schäffler, L., Scherber, C., Schwan, H., Seitz, A., Stenmans, W., Sumser, H., Zizka, V., Sorg, M.

    Mehr anzeigen...

    Monitoring der Biodiversität flugaktiver Insekten in NRW

    Nat NRW, 2023, 3

  • 2023/11

    Sickel, W., Zizka, V., Scherges, A., Bourlat, S.J., Dieker, P.

    Mehr anzeigen...

    Abundance estimation with DNA metabarcoding–recent advancements for terrestrial arthropods

    Metabarcoding and Metagenomics, 7

  • 2023/10

    Bourlat, S.J., Tschan, G.F., Martín, S., Iqram, M., Leidenberger, S.

    Mehr anzeigen...

    A red listing gap analysis of molluscs and crustaceans in Northern Europe: What has happened in the last 10 years?

    Biological conservation, 286

  • 2023/7

    Chua, P.Y., Bourlat, S.J., Ferguson, C., Korlevic, P., Zhao, L., Ekrem, T., Meier, R., Lawniczak, M.K.

    Mehr anzeigen...

    Future of DNA-based insect monitoring

    Trends in Genetics, 7, 39

  • 2023/5

    BGE Milestone MS2.4a

  • 2022

  • 2022/12

    Bourlat, S., Astrin, J.

    Mehr anzeigen...

    BGE Deliverable D4.2: Metadata standards

  • 2022/11

    Zizka, V.M., Geiger, M.F., Hörren, T., Kirse, A., Noll, N.W., Schäffler, L., Scherges, A.M., Sorg, M.

    Mehr anzeigen...

    Repeated subsamples during DNA extraction reveal increased diversity estimates in DNA metabarcoding of Malaise traps

    Ecology and Evolution, 11, 12

  • 2022/8

    Kirse, A., Bourlat, S.J., Langen, K., Zapke, B., Zizka, V.

    Mehr anzeigen...

    Comparison of destructive and nondestructive DNA extraction methods for the metabarcoding of arthropod bulk samples

    Molecular ecology resources, 1, 23

  • 2022/8

    Grobe, P., Gemeinholzer, B., Kirse, A., Saeed, A., Bourlat, S.J.

    Mehr anzeigen...

    Data Flows for Metabarcoding-based Monitoring in the Project Automated Multisensor Stations for Monitoring of Biodiversity

    Biodiversity Information Science and Standards, 6

  • 2022/3

    Wägele, J., Bodesheim, P., Bourlat, S.J., Denzler, J., Diepenbroek, M., Fonseca, V., Frommolt, K., Geiger, M.F., Gemeinholzer, B., Glöckner, F.O., Haucke, T., Kirse, A., Kölpin, A., Kostadinov, I., Kühl, H.S., Kurth, F., Lasseck, M., Liedke, S., Losch, F., Müller, S., Petrovskaya, N., Piotrowski, K., Radig, B., Scherber, C., Schoppmann, L., Schulz, J., Steinhage, V., Tschan, G.F., Vautz, W., Velotto, D., Weigend, M., Wildermann, S.

    Mehr anzeigen...

    Towards a multisensor station for automated biodiversity monitoring

    Basic and applied ecology, 59

  • 2022/1

    Zizka, V.M., Geiger, M.F., Hörren, T., Kirse, A., Noll, N.W., Schäffler, L., Scherges, A.M., Sorg, M.

    Mehr anzeigen...

    Recommendations for tissue homogenisation and extraction in DNA metabarcoding of Malaise trap samples

  • 2021

  • 2021/12

    Bruce, K., Blackman, R.C., Bourlat, S.J., Hellström, M., Bakker, J., Bista, I., Bohmann, K., Bouchez, A., Brys, R., Clark, K., Elbrecht, V., Fazi, S., Fonseca, V.G., Hänfling, B., Leese, F., Mächler, E., Mahon, A.R., Meissner, K., Panksep, K., Pawłowski, J., Yáñez, P.S., Seymour, M., Thalinger, B., Valentini, A., Woodcock, P., Traugott, M., Vasselon, V., Deiner, K.

    Mehr anzeigen...

    A practical guide to DNA-based methods for biodiversity assessment

  • 2021/10

    Elbrecht, V., Bourlat, S.J., Hörren, T., Lindner, A., Mordente, A., Noll, N.W., Schäffler, L., Sorg, M., Zizka, V.

    Mehr anzeigen...

    Pooling size sorted Malaise trap fractions to maximize taxon recovery with metabarcoding

    PeerJ, 9

  • 2021/7

    Lehmann, G.U., Bakanov, N., Behnisch, M., Bourlat, S.J., Brühl, C.A., Eichler, L., Fickel, T., Geiger, M.F., Gemeinholzer, B., Hörren, T., Köthe, S., Lux, A., Meinel, G., Mühlethaler, R., Poglitsch, H., Schäffler, L., Schlechtriemen, U., Schneider, F.D., Schulte, R., Sorg, M., Sprenger, M., Swenson, S.J., Terlau, W., Turck, A., Zizka, V.M.

    Mehr anzeigen...

    Diversity of Insects in Nature protected Areas (DINA): an interdisciplinary German research project

    Biodiversity and conservation, 8-9, 30

Mitarbeitende

Datenschutz­einstellungen
Diese Seite nutzt Cookies und Elemente Dritter, um Ihnen bestimmte Funktionen und ein optimales Webseiten-Erlebnis zu bieten. Dazu zählen Cookies, die für den Betrieb der Seite unbedingt notwendig sind, Cookies zur anonymen statistischen Analyse/Messung sowie die Einbettung von externen Diensten, deren Verwendung Sie vor der Nutzung zustimmen müssen. Weitere Informationen finden Sie unten bei den Hinweisen zu den einzelnen Funktionen sowie ausführlich in unseren Datenschutzhinweisen.
Diese Cookies sind notwendig, um die Basisfunktionen unserer Webseiten zu ermöglichen.
Diese Einwilligung erlaubt es Ihnen externe Inhalte (via IFrame) anzusehen.
Diese Einwilligung erlaubt es Ihnen eingebettete Videos anzusehen.
Seitenaufrufe werden zu anonymen statistischen Zwecken mit Matomo erfasst, um unsere Website stetig zu optimieren. Die IP-Adresse des Besuchers wird anonymisiert.
Marketing-Cookies von Google/Meta werden verwendet, um personalisierte Werbung anzuzeigen. Dies geschieht durch die Verfolgung der Besucher über Websites hinweg.
Einstellungen gespeichert