Biodiversitätsgenomik

| of

2025

• 2025/12

  Bein, B., Chrysostomakis, I., Arantes, L.S., Brown, T., Gerheim, C., Schell, T., Schneider, C., Leushkin, E., Chen, Z., Sigwart, J., Gonzalez, V., Wong, N.L.W.S., Santos, F.R., Blom, M.P.K., Mayer, F., Mazzoni, C.J., Böhne, A., Winkler, S., Greve, C., Hiller, M.

  Show more...

  Long-read sequencing and genome assembly of natural history collection samples and challenging specimens

  Genome Biology, 1, 26

  https://doi.org/

• 2025/2

  López, H., Oromí, P., Belles, X., Ylla, G., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Gut, M., Aguilera, L., Alioto, T., Ferreira, F.C., Gómez-Garrido, J., Cruz, F., Monteiro, R.

  Show more...

  ERGA-BGE Reference Genome of Loboptera subterranea: a cave adapted cockroach endemic to the Canary Islands

  https://doi.org/

• 2025/2

  Celik, T., Lokovsek, T., Buzan, E., Böhne, A., Monteiro, R., Fernandez, R., Escudero, N., Gut, M., Aguilera, L., Camara Ferreira, F., Cruz Rodriguez, F., Gomez-Garrido, J., Alioto, T.S., Bortoluzzi, C.

  Show more...

  ERGA-BGE genome of Coenonympha oedippus: an IUCN endangered European butterfly species occurring in two ecotypes

  https://doi.org/

• 2025/2

  Smith, S.H., Kukowka, S., Böhne, A.

  Show more...

  Investigation of sex determination in African cichlids reveals lack of fixed sex chromosomes in wild populations

  Journal of Evolutionary Biology

  https://doi.org/

• 2025/1

  Oriowo, T.O., Chrysostomakis, I., Martin, S., Kukowka, S., Brown, T., Winkler, S., Myers, E.W., Boehne, A., Stange, M.

  Show more...

  A chromosome-level, haplotype-resolved genome assembly and annotation for the Eurasian minnow (Leuciscidae: Phoxinus phoxinus) provide evidence of haplotype diversity

  Gigascience, 14

  https://doi.org/

• 2025/1

  Mozer, A., Di‐Nizo, C.B., Consul, A., Huettel, B., Jäger, R., Akintayo, A., Erhardt, C., Fenner, L., Fischer, D., Forat, S., Gimnich, F., Grobe, P., Martin, S., Nathan, V., Saeed, A., von der Mark, L., Woehle, C., Olek, K., Misof, B., Astrin, J.J.

  Show more...

  FOGS: A SNPSTR Marker Database to Combat Wildlife Trafficking and a Cell Culture Bank for Ex‐Situ Conservation

  Molecular Ecology resources

  https://doi.org/

• 2025/1

  Vila, M., Torrado-Blanco, L., Ryrholm, N., Romero-Pedreira, D., Conejero, M., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R., Struck, T.H., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Rodriguez, F.C., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Bortoluzzi, C.

  Show more...

  ERGA-BGE genome ofErebia palaricaChapman, 1905: a montane butterfly endemic to North-West Iberia

  https://doi.org/

• 2025/1

  Vila, M., Marí-Mena, N., Vila, R., Riesgo, A., García-Souto, D., Lopez-Vaamonde, C., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R., Struck, T.H., Gut, M., Aguilera, L., Ferreira, F.C., Rodriguez, F.C., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Bortoluzzi, C.

  Show more...

  ERGA-BGE genome of the Spanish Moon MothGraellsia isabellaeGraells, 1849: a nocturnal lepidopteran protected by the Habitats Directive

  https://doi.org/

• 2025/1

  Fernandez-Alvarez, F.A., Bernal-Bajo, A., Escudero, N., Conejero, M., Riesgo, A., Fernandez, R., Monteiro, R., Bohne, A., Aguilera, L., Gut, M., Alioto, T.S., Ferreira, F.C., Cruz, F., Gomez-Garrido, J., Brown, T.

  Show more...

  ERGA-BGE genome of Stigmatoteuthis arcturi Robson, 1948: the jewelled squid

  https://doi.org/

• 2025/1

  Chrysostomakis, I., Mozer, A., Bruno Di-Nizo, C., Fischer, D., Sargheini, N., von der Mark, L., Huettel, B., Astrin, J.J., Töpfer, T., Böhne, A.

  Show more...

  A high-quality reference genome for the Ural Owl (Strix uralensis) enables investigations of cell cultures as a genomic resource for endangered species

  https://doi.org/

• 2025/1

  Pellicer, J., Garnatje, T., Vitales, D., Hidalgo, O., Valles, J., Garcia-Fernandez, A., Santos-Guerra, A., Böhne, A., Monteiro, R., Fernandez, R., Escudero, N., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory Team, ., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations, ., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics Team, ., Thomas, A., Jackson, B., Wood, J.M., Howe, K., Blaxter, M., McCarthy, S., Bortoluzzi, C.

  Show more...

  ERGA-BGE genome of Cheirolophus tagananensis: an IUCN endangered shrub endemic to the Canary Islands

  https://doi.org/

• 2025/1

  Lavergne, S., Rosa, A., Peng, C., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T., Oomen, R.A., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Téodori, E., Demirdjian, L., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Brown, T.

  Show more...

  ERGA-BGE genome ofAndrosace saussureiDentant, Lavergne, F. C. Boucher & S. Ibanez, a recently described plant from the rooftops of Europe

  https://doi.org/

• 2025/1

  Vasileiadou, K., Manousaki, T., Dailianis, T., Skouradakis, G., Vernadou, E., Karakasi, D., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Istace, B., Couloux, A., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Bortoluzzi, C.

  Show more...

  ERGA-BGE genome ofPinctada radiata(Leach, 1814): one of the first Lessepsian migrants

  https://doi.org/

• 2025/1

  Galià-Camps, C., Pontes, M., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., De Panis, D.

  Show more...

  ERGA-BGE Reference Genome ofPhyllidia flava(Nudibranchia: Phyllidiidae), a Relict Species Endemic to the Mediterranean Sea

  https://doi.org/

2024

• 2024/12

  Mc Cartney, A.M., Formenti, G., Mouton, A., De Panis, D., Marins, L.S., Leitão, H.G., Diedericks, G., Kirangwa, J., Morselli, M., Salces-Ortiz, J., Escudero, N., Iannucci, A., Natali, C., Svardal, H., Fernández, R., De Pooter, T., Joris, G., Strazisar, M., Wood, J.M.D., Herron, K.E., Seehausen, O., Watts, P.C., Shaw, F., Davey, R.P., Minotto, A., Fernández, J.M., Böhne, A., Alegria, C., Alioto, T., Alves, P.C., Amorim, I.R., Aury, J., Backstrom, N., Baldrian, P., Baltrunaite, L., Barta, E., BedHom, B., Belser, C., Bergsten, J., Bertrand, L., Bilandija, H., Binzer-Panchal, M., Bista, I., Blaxter, M., Borges, P.A.V., Dias, G.B., Bosse, M., Brown, T., Bruggmann, R., Buena-Atienza, E., Burgin, J., Buzan, E., Cariani, A., Casadei, N., Chiara, M., Chozas, S., Čiampor, F., Crottini, A., Cruaud, C., Cruz, F., Dalen, L., De Biase, A., del Campo, J., Delic, T., Dennis, A.B., Derks, M.F.L., Diroma, M.A., Djan, M., Duprat, S., Eleftheriadi, K., Feulner, P.G.D., Flot, J., Forni, G., Fosso, B., Fournier, P., Fournier-Chambrillon, C., Gabaldon, T., Garg, S., Gissi, C., Giupponi, L., Gomez-Garrido, J., González, J., Grilo, M.L., Grüning, B., Guerin, T., Guiglielmoni, N., Gut, M., Haesler, M.P., Hahn, C., Halpern, B., Harrison, P.W., Heintz, J., Hindrikson, M., Höglund, J., Howe, K., Hughes, G.M., Istace, B., Cock, M.J., Janžekovič, F., Jonsson, Z.O., Joye-Dind, S., Koskimäki, J.J., Krystufek, B., Kubacka, J., Kuhl, H., Kusza, S., Labadie, K., Lähteenaro, M., Lantz, H., Lavrinienko, A., Leclère, L., Lopes, R.J., Madsen, O., Magdelenat, G., Magoga, G., Manousaki, T., Mappes, T., Marques, J.P., Redondo, G.I.M., Maumus, F., McCarthy, S.A., Megens, H., Melo-Ferreira, J., Mendes, S.L., Montagna, M., Moreno, J., Mosbech, M., Moura, M., Musilova, Z., Myers, E., Nash, W.J., Nater, A., Nicholson, P., Niell, M., Nijland, R., Noel, B., Noren, K., Oliveira, P.H., Olsen, R., Ometto, L., Oomen, R.A., Ossowski, S., Palinauskas, V., Palsson, S., Panibe, J.P., Pauperio, J., Pavlek, M., Payen, E., Pawlowska, J., Pellicer, J., Pesole, G., Pimenta, J., Pippel, M., Pirttilä, A.M., Poulakakis, N., Rajan, J., M.C. Rego, R., Resendes, R., Resl, P., Riesgo, A., Rodin-Morch, P., Soares, A.E.R., Fernandes, C.R., Romeiras, M.M., Roxo, G., Rüber, L., Ruiz-Lopez, M.J., Saarma, U., da Silva, L.P., Sim-Sim, M., Soler, L., Sousa, V.C., Santos, C.S., Spada, A., Stefanovic, M., Steger, V., Stiller, J., Stöck, M., Struck, T.H., Sudasinghe, H., Tapanainen, R., Tellgren-Roth, C., Trindade, H., Tukalenko, Y., Urso, I., Vacherie, B., Van Belleghem, S.M., Van Oers, K., Vargas-Chavez, C., Velickovic, N., Vella, N., Vella, A., Vernesi, C., Vicente, S., Villa, S., Pettersson, O.V., Volckaert, F.A.M., Voros, J., Wincker, P., Winkler, S., Ciofi, C., Waterhouse, R.M., Mazzoni, C.J.

  Show more...

  The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics

  npj Biodiversity, 1, 3

  https://doi.org/

• 2024/12

  Böhne, A., Fernández, R., Leonard, J.A., McCartney, A.M., McTaggart, S., Melo-Ferreira, J., Monteiro, R., Oomen, R.A., Vinnere Pettersson, O., Struck, T.H.

  Show more...

  Contextualising samples: supporting reference genomes of European biodiversity through sample and associated metadata collection

  npj Biodiversity, 1, 3

  https://doi.org/

• 2024/12

  Dietz, L., Kukowka, S., Eberle, J., Mayer, C., Niehuis, O., Podsiadlowski, L., Ahrens, D.

  Show more...

  Museomics reveal origins of East African Pleophylla forest chafers and Miocene forest connectivity

  Molecular Phylogenetics and Evolution, 201

  https://doi.org/

• 2024/12

  Lozano-Fernandez, J., Domènech, M., Ibos, A., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., De Panis, D.

  Show more...

  ERGA-BGE Reference Genome of Gluvia dorsalis: An Endemic Sun Spider from Iberian Arid Regions

  https://doi.org/

• 2024/12

  Janžekovič, F., Buzan, E., Bončina, A., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Haggerty, L., Martin, F., De Panis, D.

  Show more...

  ERGA-BGE Reference Genome of the Striped Field Mouse (Apodemus agrarius), a Widespread and Abundant Species in Central and Eastern Europe

  https://doi.org/

• 2024/11

  Buzan, E., Bončina, A., Pokorny, B., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Monteiro, R., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Haggerty, L., Martin, F., De Panis, D.

  Show more...

  ERGA-BGE Reference Genome of the Northern chamois (Rupicapra rupicapra): Europe’s most abundant mountain ungulate

  https://doi.org/

• 2024/10

  Wantania, L.L., Koppetsch, T., Möhring, J., Miesen, F.W., Wowor, D., Boneka, F., Herder, F.

  Show more...

  Sulawesi stream fish communities depend on connectivity and habitat diversity

  Journal of Fish Biology

  https://doi.org/

• 2024/10

  Peters, R., Rduch, V.

  Show more...

  German Barcode of Life, Entdeckung und Beschreibung neuer Arten

• 2024/10

  Bräunig, C., Meid, S., Quast, B., Rduch, V., Grobe, P.

  Show more...

  The ASV Registry: a place for ASVs to be

  Metabarcoding and Metagenomics, 8

  https://doi.org/

• 2024/8

  Vogel, J., Forshage, M., Bartsch, S.B., Ankermann, A., Mayer, C., Falkenhausen, P.v., Rduch, V., Müller, B., Braun, C., Krammer, H., Peters, R.S.

  Show more...

  Integrative characterisation of the Northwestern European species of Anacharis Dalman, 1823 (Hymenoptera, Cynipoidea, Figitidae) with the description of three new species

  Journal of Hymenoptera Research, 97

• 2024/8

  Rduch, V., Dey, L., Ghazaryan, A., Husemann, M., Iankoshvili, G., Krammer, H., Lambrecht, M., Marabuto, E., Mengual, X., Müller, B., Peters, R., Rulik, B., Salden, T., Silva-Brandao, K.L., Espeland, M., Thormann, J., Töpfer, T., Weiss, C., Zyla, D., Hein, N.

  Show more...

  Exkursion in den Kaukasus: Der CaBOL BioBlitz 2022 in Armenien und Georgien