Rita Mafalda Soares Monteiro

| von

2025

• 2025/10

  Aurelle, D., Guillemain, D., Zuberer, F., Malengros, D., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Struck, T.H., A. Oomen, R., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Belser, C., Wincker, P., H. Oliveira, P., Aury, J., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE reference genome of Eunicellacavolini, an IUCN Near Threatened Gorgonian of the Mediterranean Sea

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/10

  Verdes, A., Alvarez-Campos, P., Conejero, M., Riesgo, A., Böhne, A., Monteiro, R., Palma-Guerrero, J., Fernández, R., Gut, M., Aguilera, L., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., S. Alioto, T., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE reference genome of the lineid heteronemertean Lineuslacteus (Pilidiophora, Nemertea)

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/09

  Fernández-Álvarez, F.Á., Bernal-Bajo, A., Escudero, N., Conejero, M., Riesgo, A., Fernández, R., Monteiro, R., Böhne, A., Aguilera, L., Gut, M., Alioto, T.S., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.

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  ERGA-BGE genome of Stigmatoteuthisarcturi Robson, 1948: the jewelled squid

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/09

  Georgakakis, P., Karakasi, D., Lymberakis, P., Papadimitrakis, M., Stratakis, M., Bitzilekis, E., Poulakakis, N., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Mangenot, S., Belser, C., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE reference genome of Hanak's bat (Pipistrellus hanaki), an IUCN Vulnerable species restricted to forest-like biotopes

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/09

  Vasileiadou, K., Dailianis, T., Skouradakis, G., Vernadou, E., Karakasi, D., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Manousaki, T., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Ndar, A., Wincker, P., H Oliveira, P., Aury, J., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE reference genome of Holothuria (Platyperona) sanctori: a sea cucumber from the Mediterranean Sea

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/08

  Bolanakis, G., Karakasi, D., Bitzilekis, E., Stratakis, M., Trichas, A., Lymberakis, P., Poulakakis, N., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Téodori, E., Wincker, P., H. Oliveira, P., Aury, J., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of Dailognatha quadricollis, an East Mediterranean darkling beetle

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/08

  Emerson, B.C., Conejero, M., Riesgo, A., Noguerales, V., Monteiro, R., Böhne, A., Guerrero, J.P., Fernández, R., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory team, ., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations, ., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics team, ., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.

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  ERGA-BGE genome of the ironclad beetle Tarphiuscanariensis Wollaston, 1862

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/08

  Carranza, S., Fernández-Guiberteau, D., Blasón, L., Tulloch, S., Monteiro, R., Böhne, A., Fernández, R., Escudero, N., Aguilera, L., Gut, M., Alioto, T.S., Câmara Ferreira, F., Gómez-Garrido, J., Cruz, F., Sinha, S., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.

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  ERGA-BGE Genome of the viperine water snake (Natrixmaura): a key species for evolutionary insights of freshwater snakes

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/08

  Lopes, R.J., Böhne, A., Marcussen, T., Oomen, R.A., Struck, T.H., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Monteiro, R.

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  ERGA-BGE reference genome of the Azores Bullfinch - Pyrrhulamurina Godman, 1866: an IUCN Vulnerable Species endemic to a single island in the Azores Archipelago (Portugal)

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/07

  Hausdorf, B., Tapia, E., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T., Oomen, R.A., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory team, ., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations, ., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics team, ., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.

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  ERGA-BGE genome of Anisus vorticulus (Troschel, 1834): the Lesser Ramshorn Snail, an endangered freshwater snail protected under the EU's Habitats and Species Directive

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/06

  Reichel, K., Pohjoismäki, J., Astrin, J., Böhne, A., Bortoluzzi, C., Campo, J.d., Ciofi, C., Di-Nizo, C.B., Divakar, P.K., Greve, C., Hampl, V., Hilgers, L., Laine, V.N., Leonard, J.A., Lozano-Fernandez, J., Bilela, L.L., Mazzoni, C., McCartney, A., Melo-Ferreira, J., Monteiro, R., Oomen, R.A., Pavlek, M., Pimenta, J., Rindos, M., Seehausen, O., Tarieiev, A., Tomasello, S., Pettersson, O.V., Waterhouse, R.M., Weber, A.A.-T., Zinenko, O., Guttry, C.d.

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  Addressing key challenges in sample handling for high-quality reference genome generation

  https://doi.org/

• 2025/06

  Reichel, K., Pohjoismäki, J., Astrin, J., Böhne, A., Bortoluzzi, C., Buzan, E., Campo, J.d., Ciofi, C., Di-Nizo, C.B., Divakar, P.K., Greve, C., Hampl, V., Hilgers, L., Laine, V.N., Leonard, J.A., Lozano-Fernandez, J., Bilela, L.L., Mazzoni, C., McCartney, A., Melo-Ferreira, J., Monteiro, R., Oomen, R.A., Pavlek, M., Pimenta, J., Rindos, M., Seehausen, O., Tarieiev, A., Tomasello, S., Pettersson, O.V., Waterhouse, R.M., Weber, A.A.-T., Zinenko, O., Guttry, C.d.

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  Addressing key challenges in sample handling for high-quality reference genome generation

  https://doi.org/

• 2025/06

  Bolanakis, G., Karakasi, D., Trichas, A., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Bitzilekis, E., Stratakis, M., Lymberakis, P., Poulakakis, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Duprat, S., Téodori, E., Wincker, P., H. Oliveira, P., Aury, J., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of Dendarusforaminosus: an IUCN Least Concern darkling beetle endemic to Crete (Greece)

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/05

  Lozano-Fernandez, J., Domènech, M., Ibos, A., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., De Panis, D.

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  ERGA-BGE reference genome of Gluviadorsalis: An endemic sun spider from Iberian arid regions

  https://doi.org/

• 2025/04

  Carranza, S., Fernández-Guiberteau, D., Blasón, L., Palma-Guerrero, J., Fernández, R., Monteiro, R., Böhne, A., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., De Panis, D.

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  ERGA-BGE reference genome of the Western Montpellier Snake (Malpolonmonspessulanus), a key species for evolutionary and venom studies

  https://doi.org/

• 2025/04

  Buzan, E., Bončina, A., Pokorny, B., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T., Haggerty, L., Martin, F., De Panis, D.

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  ERGA-BGE Reference Genome of the Northern chamois (Rupicaprarupicapra): Europe’s most abundant mountain ungulate

  https://doi.org/

• 2025/04

  Janžekovič, F., Buzan, E., Bončina, A., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T., Haggerty, L., Martin, F., De Panis, D.

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  ERGA-BGE reference genome of the Striped Field Mouse (Apodemusagrarius), a widespread and abundant species in Central and Eastern Europe

  https://doi.org/

• 2025/04

  Vasileiadou, K., Manousaki, T., Dailianis, T., Skouradakis, G., Vernadou, E., Karakasi, D., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Team, G.S., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Istace, B., Couloux, A., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of Pinctadaradiata (Leach, 1814): one of the first Lessepsian migrants

  https://doi.org/

• 2025/04

  Vasileiadou, K., Manousaki, T., Dailianis, T., Skouradakis, G., Vernadou, E., Karakasi, D., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Team, G.S., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Téodori, E., Duprat, S., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of Noah`s Ark shell (Arcanoae Linnaeus, 1758), a Mediterranean bivalve species

  https://doi.org/

• 2025/04

  Pellicer, J., Garnatje, T., Vitales, D., Hidalgo, O., Vallès, J., García-Fernández, A., Santos-Guerra, A., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Samples and Laboratory Team, W.S.I.T.o.L.M., Sequencing Operations, W.S.I.S.O., Tree of Life Core Informatics Team, W.S.I., Thomas, A., Jackson, B., Wood, J.M., Howe, K., Blaxter, M., McCarthy, S., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of Cheirolophustagananensis: an IUCN endangered shrub endemic to the Canary Islands

  https://doi.org/

• 2025/04

  Čelik, T., Lokovšek, T., Bužan, E., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Gut, M., Aguilera, L., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of Coenonymphaoedippus: an IUCN endangered European butterfly species occurring in two ecotypes

  https://doi.org/

• 2025/03

  Lymberakis, P., Karakasi, D., Papadimitrakis, M., Monteiro, R., Böhne, A., Fernández, R., Escudero, N., Aury, J., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Mangenot, S., Belser, C., Demirdjian, L., Sinha, S., Haggerty, L., Martin, F., Wincker, P., Oliveira, P.H., Brown, T.

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  ERGA-BGE genome of Acomysminous (Bate, 1906): the Crete spiny mouse, endemic to the island of Crete, Greece

  https://doi.org/

• 2025/03

  Ventura, M., Franch, N., Fernández, R., Palma-Guerrero, J., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Alioto, T.S., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.

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  ERGA-BGE genome of Valenciahispanica (Valenciennes, 1826): a critically endangered Iberian toothcarp

  https://doi.org/

• 2025/02

  López, H., Oromí, P., Belles, X., Ylla, G., Escudero, N., Fernández, R., Böhne, A., Gut, M., Aguilera, L., Alioto, T., Ferreira, F.C., Gómez-Garrido, J., Cruz, F., Monteiro, R.

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  ERGA-BGE reference genome of Lobopterasubterranea: a cave adapted cockroach endemic to the Canary Islands

  https://doi.org/

• 2025/01

  Vila, M., Torrado-Blanco, L., Ryrholm, N., Romero-Pedreira, D., Conejero, M., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R., Struck, T.H., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Rodriguez, F.C., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of Erebia palarica Chapman, 1905: a montane butterfly endemic to North-West Iberia

  https://doi.org/

• 2025/01

  Vila, M., Marí-Mena, N., Vila, R., Riesgo, A., García-Souto, D., Lopez-Vaamonde, C., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R., Struck, T.H., Gut, M., Aguilera, L., Ferreira, F.C., Rodriguez, F.C., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Haggerty, L., Martin, F., Bortoluzzi, C.

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  ERGA-BGE genome of the Spanish Moon Moth Actias isabellae Graells, 1849: A nocturnal lepidopteran protected by the Habitats Directive

  Open Research Europe, 5

  https://doi.org/

• 2025/01

  Lavergne, S., Rosa, A., Peng, C., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T., Oomen, R.A., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Téodori, E., Demirdjian, L., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Brown, T.

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  ERGA-BGE genome of Androsace saussurei Dentant, Lavergne, F. C. Boucher & S. Ibanez, a recently described plant from the rooftops of Europe

  https://doi.org/

• 2025/01

  Galià-Camps, C., Pontes, M., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R., Böhne, A., Monteiro, R., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., De Panis, D.

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  ERGA-BGE reference genome of Phyllidia flava (Nudibranchia: Phyllidiidae), a relict species endemic to the Mediterranean Sea

  https://doi.org/

2024

• 2024/12

  Böhne, A., Fernández, R., Leonard, J.A., McCartney, A.M., McTaggart, S., Melo-Ferreira, J., Monteiro, R., Oomen, R.A., Vinnere Pettersson, O., Struck, T.H.

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  Contextualising samples: supporting reference genomes of European biodiversity through sample and associated metadata collection

  npj Biodiversity, 1, 3

  https://doi.org/