Vergleichende Genomik Wirbeltiere, Bonn

Unsere Aufgabe

Die vergleichende Analyse von Genomen und Transkriptomen etabliert sich als ein elementarer Bestandteil der Biodiversitätsforschung. Neue Sequenziertechnologien sowie Entwicklungen von Analysemethoden und Algorithmen ermöglichen es uns Proben aus Sammlungen und der Umwelt, insbesondere von Nichtmodellorganismen, sowie gesamte Populationen zu untersuchen.

Die Sektion Biodiversitätsgenomik am zmb analysiert genomische Daten in einem evolutionären Kontext und versucht damit, phänotypische und genomische Veränderungen zu verknüpfen um Biodiversität besser zu verstehen.

Verknüpfung von Genotyp und Phänotyp

Dr. Astrid Böhne vertritt diese Sektion mit einer herausragenden Expertise in den Bereichen de novo Sequenzierung und Assemblierung sowie vergleichender genomweiter Analysen.
Der Fokus dieser Sektion liegt dabei auf der genomischen Architektur von phänotypischen Neuigkeiten und adaptiven Eigenschaften sowie Artbildungsprozessen.

Projekte der Sektion Vergleichende Genomik - Wirbeltiere beschäftigen sich im Detail mit Populationsdynamiken, Artenbildung, Genfluß, Hybridisierung, Adaptation und Konflikten zwischen den Geschlechtern.

Biodiversität

Wir interessieren uns für den Ursprung, die Interaktion und Verteilung von neuen Arten und fokussieren uns dabei insbesondere auf extrem erfolgreiche Tiergruppen die Teil von Artbildungs-Hotspots und (adaptiven) Radiationen sind aber auch invasive und hybridisierende Arten um Treiber und Bedrohungen von Biodiversität genomisch zu verstehen.

Dr. habil. Astrid Böhne

Sektionsleitung

Tel.: +49 228 9122 365
E-Mail: a.boehne@leibniz-lib.de

Projekte

Alle Projekte

SynSex - Sexuelle Selektion und Konflikt in Syngnathidae
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
BIGFOOT - BIodiversity decline's Genomic FOOTprint
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
ColLomic
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
ERGA - Der europäische Referenzgenomatlas
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
BGE - Biodiversitätsgenomik Europa
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne
Geschlechtschromosomen in Buntbarschen
Leitung: Dr. habil. Astrid Böhne

Publikationen

| von

2026

2026/02
Antaloudaki, E., Karakasi, D., Stratakis, M., Bitzilekis, E., Lymberakis, P., Poulakakis, N., Manousaki, T., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Martin, F., Barrera Enriquez, V.P., Haggerty, L., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of Carlina diae, an endemic spineless thistle of Crete, Greece
Open Research Europe, 6
2026/01
Taboada, S., Gracia-Sancha, C., Galià-Camps, C., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R.A., Struck, T.H., Gut, M., Aguilera, L., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., Alioto, T.S., Martin, F., Lazar, A., Haggerty, L., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of Xylophaga dorsalis - a common deep-sea wood-boring bivalve with Atlantic-Mediterranean distribution
Open Research Europe, 6
2026/01
Novo, M., Marchán, D.F., Gérard, S., Navarro, A.M., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R.A., Aguilera, L., Gut, M., Ferreira, F.C., Gómez-Garrido, J., Cruz, F., Alioto, T., Lazar, A., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.
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ERGA-BGE Genome of Ailoscolex lacteospumosus Bouché, 1969 – the enigmatic milky worm endemic to the Pyrenees
Open Research Europe, 6
2026/01
Karakasi, D., Vardinoyannis, K., Bolanakis, G., Bitzilekis, E., Stratakis, M., Lymberakis, P., Poulakakis, N., Monteiro, R., Böhne, A., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., N’dar, A., Tricomi, F.F., Haggerty, L., Martin, F., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Brown, T.
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ERGA-BGE genome of Albinariateres (Olivier, 1801): a rock-dwelling land snail endemic to the island of Crete, Greece
Open Research Europe, 6
2026/01
Reichel, K., Pohjoismäki, J., Astrin, J., Böhne, A., Bortoluzzi, C., Bužan, E., del Campo, J., Ciofi, C., Di Nizo, C., Divakar, P.K., Greve, C., Hampl, V., Hilgers, L., Laine, V.N., Leonard, J.A., Lozano-Fernandez, J., Lukić Bilela, L., Mazzoni, C.J., McCartney, A.M., Melo-Ferreira, J., Monteiro, R., Oomen, R.A., Pavlek, M., Pimenta, J., Rindos, M., Seehausen, O., Tarieiev, A., Tomasello, S., Vinnere Pettersson, O., Waterhouse, R.M., Weber, A.A.-T., Zinenko, O., de Guttry, C.
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From permits to samples: Addressing key challenges for high-quality reference genome generation in Europe
Molecular Ecology resources, 2, 26
2026/01
Brito, J., Vargas, R., Tinoco, N., García, R., Carrión-Olmedo, J.C., Koch, C., Wistuba, R., Nivelo-Villavicencio, C., Pardiñas, U.F.J.
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Mountains of diversity: a systematic revision of the Andean rodent genus Oreoryzomys (Cricetidae: Sigmodontinae)
PeerJ, 14
2026/01
Vila Taboada, M., Torrado-Blanco, L., Ryrholm, N., Romero-Pedreira, D., Conejero, M., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., A. Oomen, R., H. Struck, T., Aguilera, L., Gut, M., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., S. Alioto, T., Haggerty, L., Martin, F., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE genome of Erebia palarica Chapman, 1905: a montane butterfly endemic to North-West Spain
Open Research Europe, 6

2025

2025/12
Manzano-Marín, A., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R.A., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Management, Samples and Laboratory Team, ., Wellcome Sanger Institute Scientific Operations: Sequencing Operations, ., Wellcome Sanger Institute Tree of Life Core Informatics Team, ., Howard, C., Howe, K., Blaxter, M., McCarthy, S., Wood, J.M.D., Martin, F., Lazar, A., Haggerty, L., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of Hirudoverbana, a once neglected freshwater haematophagous European medicinal leech
Open Research Europe, 5
2025/12
Jankowiak, Ł., Hoffmann, A., Decher, J., Szkudlarek, M., Eccel, N., Popiel, P., Malinowska, B., Sęk, O., Rychlik, L.
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Wooden or metal: live-trap type preferences of small mammals in relation to habitat, taxon, and sex
Mammalian Biology
2025/12
Wantania, L.L., Möhring, J., Koppetsch, T., Miesen, F.W., Wowor, D., Boneka, F., Herder, F.
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Sulawesi Stream Fish Communities Disconnected From the Sea: Absence of Diadromous and Dominance of Exotic Species
Freshwater biology, 12, 70
2025/12
Bover, P., Brito, J., Castellanos, F.X., Cuéllar Soto, E., Hutterer, R., Alfaro-Ibáñez, M.P., Martín González, M.E., Tammone, M.N., Pardiñas, U.F.J.
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Revisiting the taxonomy and biogeography of the largest sigmodontine rodent (Rodentia, Cricetidae) through ancient DNA
Zoological journal of the Linnean Society, 4, 205
2025/11
Verdes, A., Alvarez-Campos, P., Conejero, M., Riesgo, A., Böhne, A., Monteiro, R., Palma-Guerrero, J., Fernández, R., Gut, M., Aguilera, L., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., S. Alioto, T., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of the lineid heteronemertean Lineuslacteus (Pilidiophora, Nemertea)
Open Research Europe, 5
2025/11
Bolanakis, G., Karakasi, D., Trichas, A., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Bitzilekis, E., Stratakis, M., Lymberakis, P., Poulakakis, N., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Duprat, S., Téodori, E., Wincker, P., H. Oliveira, P., Aury, J., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE genome of Dendarusforaminosus: an IUCN Least Concern darkling beetle endemic to Crete (Greece)
Open Research Europe, 5
2025/11
Lavergne, S., Rosa, Z., Peng, C., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R.A., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Téodori, E., Demirdjian, L., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Barrera Enriquez, V.P., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.
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ERGA-BGE genome of Androsacesaussurei Dentant, Lavergne, F. C. Boucher & S. Ibanez, a recently described plant from the rooftops of Europe
Open Research Europe, 5
2025/11
Tomasello, S., Manzo, E., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R.A., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., N’dar, A., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J., Barrera Enriquez, V.P., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.
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ERGA-BGE genome of Xanthiumorientale subsp. italicum (Moretti) Greuter. A plant of American origin, now widespread and, in some cases, invasive in Europe
Open Research Europe, 5
2025/11
Gregorič, M., Bužan, E., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Gut, M., Aguilera, L., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., S. Alioto, T., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of Leviellus thorelli, a common orb-weaving spider representing the Zygiellidae family
Open Research Europe, 5
2025/11
Aguado-Ramsay, P., Lara, F., Draper, I., Conejero, M., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., H. Struck, T., A. Oomen, R., Genomescope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Téodori, E., Wincker, P., H. Oliveira, P., Aury, J., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of Lewinskya acuminata, a common epiphytic Mediterranean moss with disjunct populations in California and Ethiopia
Open Research Europe, 5
2025/11
Struck, T.H., Marcussen, T., Böhne, A., Fernández, R., Melo-Ferreira, J., Florent, I., Gissi, C., Guttry, C., Leonard, J.A., McTaggart, S., Mazzoni, C., Monteiro, R., Pettersson, O.V., Pimenta, J., Pohjoismäki, J., Reichel, K., Tarieiev, A., Oomen, R.A.
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An automated decision-making procedure for ranking and selecting species in biodiversity projects
2025/11
Faria, R., Nieto Vilela, R., Lima, F.P., Monteiro, R., Böhne, A., Marcussen, T., Struck, T.H., Oomen, R.A., Gut, M., Aguilera, L., Alioto, T., Câmara Ferreira, F., Gómez-Garrido, J., Cruz, F., Lazar, A., Haggerty, L., Martin, F., Brown, T.
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ERGA-BGE genome of Patella rustica Linnaeus, 1758: a resource to investigate responses to global warming in the intertidal
Open Research Europe, 5
2025/10
Dietz, L., Eberle, J., Kukowka, S., Podsiadlowski, L., Bazzato, E., Stange, M., Warnock, R.C.M., Niehuis, O., Mayer, C., Ahrens, D.
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Cryptic Species Can Be Phylogenetically Old Despite Strong Sex-Biased Dispersal
Systematic Biology
2025/10
Verdes, A., Alvarez-Campos, P., Conejero, M., Riesgo, A., Böhne, A., Monteiro, R., Palma-Guerrero, J., Fernández, R., Gut, M., Aguilera, L., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., S. Alioto, T., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of the lineid heteronemertean Lineuslacteus (Pilidiophora, Nemertea)
Open Research Europe, 5
2025/10
Aurelle, D., Guillemain, D., Zuberer, F., Malengros, D., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Struck, T.H., A. Oomen, R., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Belser, C., Wincker, P., H. Oliveira, P., Aury, J., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of Eunicella cavolini, an IUCN Near Threatened Gorgonian of the Mediterranean Sea
Open Research Europe, 5
2025/10
Hsiung, K., Smith, S.H., Böhne, A.
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ZW and XY sex chromosomes drive rapid and distinctive evolution of sex-biased gene expression
Molecular Ecology
2025/09
Vila, M., Marí-Mena, N., Vila, R., Riesgo, A., García-Souto, D., Lopez-Vaamonde, C., Böhne, A., Monteiro, R., Marcussen, T., Oomen, R., Struck, T.H., Gut, M., Aguilera, L., Câmara Ferreira, F., Cruz, F., Gómez-Garrido, J., S. Alioto, T., Haggerty, L., Martin, F., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE genome of the Spanish moon moth Actias isabellae Graells, 1849: a nocturnal lepidopteran protected by the Habitats Directive
Open Research Europe, 5
2025/09
Vasileiadou, K., Dailianis, T., Skouradakis, G., Vernadou, E., Karakasi, D., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Manousaki, T., Genoscope Sequencing Team, ., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Ndar, A., Wincker, P., H Oliveira, P., Aury, J., Bortoluzzi, C.
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ERGA-BGE reference genome of Holothuria (Platyperona) sanctori: a sea cucumber from the Mediterranean Sea
Open Research Europe, 5

Mitarbeitende

Alle Mitarbeitenden

MSc Aryadevi Anitha Shaji
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / Doktorand
Tel.: +49 228 9122 407
E-Mail: a.shaji@leibniz-lib.de
Dr. habil. Astrid Böhne
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
Tel.: +49 228 9122 365
E-Mail: a.boehne@leibniz-lib.de
MSc Nina Casillas
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / Doktorand
Tel.: +49 228 9122 379
E-Mail: n.casillas@leibniz-lib.de
MSc Ioannis Chrysostomakis
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / Doktorand
Tel.: +49 228 9122 369
E-Mail: i.chrysostomakis@leibniz-lib.de
MSc Kevin Hsiung
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / Doktorand
Tel.: +49 228 9122 369
E-Mail: k.hsiung@leibniz-lib.de
Sandra Kukowka
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere
Tel.: +49 228 9122 343
E-Mail: s.kukowka@leibniz-lib.de
Jan Möhring
zmb ztm Ichthyologie Bonn Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / Doktorand
Tel.: +49 228 9122 431
E-Mail: j.moehring@leibniz-lib.de
MSc Sophie Smith
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Doktorandin / Doktorand
Tel.: +49 228 9122 369
E-Mail: s.smith@leibniz-lib.de
Rita Mafalda Soares Monteiro
zmb Vergleichende Genomik – Wirbeltiere Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
Tel.: +49 228 9122 369
E-Mail: r.monteiro@leibniz-lib.de