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Molekulare Biodiversität

Was machen wir?

Wir erforschen die Biodiversität der Tiere aus der molekularen Perspektive, insbesondere im Kontext der Diversität der Moleküle in jeder Zelle. Jedes Genom ist ein Ökosystem von Molekülen mit verschiedensten parasitischen, mutualistischen und symbiotischen Interaktionen miteinander. Wir erforschen genetische Konflikte zwischen molekularen Parasiten wie transposable Elemente, Viren und B-Chromosomen, und wie diese die Genomstruktur des Wirts beeinflussen und, durch Effekte auf reproduktive Isolation, dadurch den Biodiversitätswandel. Nur durch das Verständnis der Tiefen der unbekannten genetischen Diversität lässt sich die unbekannte Biodiversität besser verstehen.

Wie machen wir das?

Obwohl ein Großteil unserer laufenden Forschung sich auf die unbekannte genetische Diversität der Vögel fokussiert, vor allem in Form von Unterschieden zwischen Keimbahn- und Soma-Genomen, ist unsere Forschung nicht Taxon-zentriert sondern Konzept-zentriert. Unsere vergangenen und laufenden Projekte befassten sich auch mit Krokodilen, Schildkröten, Knochenfischen, Insekten, Krustentieren, Bärtierchen, Rundwürmern, Armfüßern und Pilzen.

 

Unsere Forschung verknüpft Methoden und Konzepte der evolutionären Genomik, Molekularbiologie, Entwicklungsbiologie, molekularen Zytogenetik und funktionalen Genomik. Außerdem wenden wir taxonomische Prinzipien bei der Charakterisierung von transposablen Elementen und Viren an.

Wer sind wir?

Unser Team ist interdisziplinär und multikulturell mit Mitgliedern aus derzeit 8 Nationen, sowie in verschiedenen nationalen und internationalen Forschungsnetzwerken aktiv involviert. Unsere momentane Forschung wird finanziert vom Europäischen Forschungsrat (ERC Consolidator Grant "GermlineChrom"), der Leibniz-Gemeinschaft (Leibniz-Lab Pandemic Preparedness), dem Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels und der Universität Bonn.

Ansprechperson

Prof. Dr. Alexander Suh

  • Leitung Zentrum für Molekulare Biodiversitätsforschung (zmb)
  • Leitung Sektion Molekulare Biodiversität

Tel.: +49 228 9122 289
E-Mail: a.suh@leibniz-lib.de

Projekte

Publikationen

| von

    2026

  • 2026/01

    Brito, J., Vargas, R., Tinoco, N., García, R., Carrión-Olmedo, J.C., Koch, C., Wistuba, R., Nivelo-Villavicencio, C., Pardiñas, U.F.J.

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    Mountains of diversity: a systematic revision of the Andean rodent genus Oreoryzomys (Cricetidae: Sigmodontinae)

    PeerJ, 14

  • 2026/01

    Lasmar, L.F., Vidal, M.R., Nadai, P.C.F., dos Santos, R.Z., Machado, R.d.C., Utsunomia, R., Ruiz-Ruano, F.J., Suh, A., Oliveira, C., M. Z. A. Silva, D., Foresti, F.

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    B chromosome retrotransposed sequences persist through speciation, contributing to genomic and regulatory innovations in the fish genus Psalidodon (Characiformes, Acestrorhamphidae)

    PloS one, 1, 21

  • 2025

  • 2025/12

    Vontzou, N., Pei, Y., Campo-Bes, I., Forstmeier, W., Hertel, M., Irimia, M., Kempenaers, B., Kuhn, S., Martin, K., Mueller, J.C., Teltscher, K., Mollbrink, A., Abalo, X., Biegler, M.T., Immler, S., Ruiz-Ruano, F.J., Suh, A.

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    The germline-restricted chromosome orchestrates germ cell development in passerine birds

  • 2025/12

    Jankowiak, Ł., Hoffmann, A., Decher, J., Szkudlarek, M., Eccel, N., Popiel, P., Malinowska, B., Sęk, O., Rychlik, L.

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    Wooden or metal: live-trap type preferences of small mammals in relation to habitat, taxon, and sex

    Mammalian Biology

  • 2025/10

    Polo, B., Milanoi, S., Omoke, D.N., Odhiambo, C.A., Nagi, S.C., Nwezeobi, J., Makunin, A.I., Boddé, M., Abong’o, B., Midega, J., Kamau, L., Onguru, D., Miles, A., Lawniczak, M., Ochomo, E.

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    Genetic isolation drives divergent insecticide resistance between coastal and western Kenya Anopheles funestus populations

    Scientific reports, 1, 15

  • 2025/10

    Formenti, G., Jain, N., Medico, J.A., Sollitto, M., Antipov, D., Barcellos, S., Biegler, M., Borges, I., Chang, J.K., Chen, Y., Cheng, H., Conceição, H., Davenport, M., De Oliveira, L., Duarte, E., Durham, G., Fenn, J., Forde, N., Galante, P.A., Gerhardt, K., Giani, A.M., Giunta, S., Kim, J., Komissarov, A., Koo, B., Koren, S., Larkin, D., Lee, C., Li, H., Makova, K., Masterson, P., Murphy, T., McCaffrey, K., Mercuri, R.L.V., Na, Y., O’Connell, M.J., Ou, S., Phillippy, A., Popova, M., Rhie, A., Ruiz-Ruano, F.J., Secomandi, S., Smeds, L., Suh, A., Tilley, T., Vontzou, N., Waters, P.D., Balacco, J., Jarvis, E.D.

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    The complete genome of a songbird

  • 2025/10

    Lutgen, D., Peona, V., Chase, M.A., Kakhki, N.A., Lammers, F., de Souza, S.G., Ducrest, A., Burri, M., Andriopoulos, P., Lukhele, S.M., Moysi, M., Yohannes, E., Abbasov, A., Albayrak, T., Aliabadian, M., Auchli, N., Bontzorlos, V., Christoforou, I., Copete, J.L., Fulco, E., Garcia, J.T., Javakhishvili, Z., Kazazou, A., Lei, F., Liu, Y., Paposhvili, N., Patchett, R., Péter, Á., Ritter, R., Sándor, A.D., Schneider, F., Shurulinkov, P., Sklyarenko, S., Stumberger, B., Tagiyev, A., Uboldi, A., Vogiatzis, N., Taborsak-Lines, F., Gruselius, J., Yao, L., Peichel, C.L., Suh, A., Gagnaire, P., Kirschel, A.N.G., Schweizer, M., Schielzeth, H., Burri, R.

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    A mosaic of modular variation at a single gene underpins convergent plumage coloration

    Science, 6770, 390

  • 2025/10

    Pei, Y., Forstmeier, W., Suh, A., Bambach, L., Borges, I., Low, G.W., Dion-Côté, A., Knief, U., Wolf, J., Kempenaers, B.

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    Evolution of large polymorphic inversions in a panmictic songbird

    Molecular Biology and Evolution

  • 2025/10

    Roussel, A., Suh, A., Ruiz-Ruano, F.J., Dion-Côté, A.

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    Accumulation of a biparentally-inherited Neptune transposable element in natural Killifish hybrids (Fundulus diaphanus × F. heteroclitus)

    Molecular Biology and Evolution

  • 2025/10

    Palacios-Gimenez, O.M., Varma, M., Cheng, X., Mosbech, M., Suh, A., Schielzeth, H.

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    Chromosome-level assembly of the club-legged grasshopper (Gomphocerus sibiricus) genome

    G3

  • 2025/09

    Boddé, M., Nwezeobi, J., Korlević, P., Makunin, A., Akone-Ella, O., Barasa, S., Gadji, M., Hart, L., Kaindoa, E.W., Love, K., Lucas, E.R., Lujumba, I., Máquina, M., Nagi, S.C., Odero, J.O., Polo, B., Sangbakembi, C., Dadzie, S., Koekemoer, L.L., Kwiatkowski, D., McAlister, E., Ochomo, E., Okumu, F., Paaijmans, K., Tchouassi, D.P., Wondji, C.S., Ayala, D., Durbin, R., Miles, A., Lawniczak, M.K.N.

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    Genomic diversity of the African malaria vector Anopheles funestus

    Science, 6766, 389

  • 2025/08

    Neumeister, D.S., Gonzalez, D., Gaugel, S.M., Yazıcı, T., Haug, J.T., Schielzeth, H., Bailey, R.I., Pereira, R.J.

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    Clarifying diversity in the radiation of Chorthippus grasshoppers (Orthoptera: Acrididae) through an integration of genomic and morphometric approaches

    Zoological journal of the Linnean Society, 4, 204

  • 2025/07

    Ruiz-Ruano, F.J., Schlebusch, S.A., Vontzou, N., Moreno, H., Biegler, M.T., Kutschera, V.E., Ekman, D., Borges, I., Pei, Y., Rossini, R., Albrecht, T., Boman, J., Borodin, P., Burri, R., Cain, K.E., Forstmeier, W., Frankl-Vilches, C., Gahr, M., Griffith, S.C., Hill, A.M., Irestedt, M., Joseph, L., Jønsson, K.A., Kawakami, T., Kempenaers, B., Malinovskaya, L., Mueller, J.C., Oliveira, E.H.C.d., Palacios-Gimenez, O.M., Palinauskas, V., Qvarnström, A., Reifova, R., Ridl, J., Segami, J.C., Tan, D.J.X., Torgasheva, A., Whibley, A., Suh, A.

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    Programmed DNA elimination drives rapid genomic innovation in two thirds of all bird species

    bioRxiv

  • 2025/07

    Rídl, J., Dedukh, D., Halenková, Z., Schlebusch, S.A., Beneš, V., Lopez, M.O., Osiejuk, T.S., Ruiz-Ruano, F.J., Suh, A., Albrecht, T., Reif, J., Reifová, R.

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    Germline-restricted chromosome of songbirds has different centromere compared to regular chromosomes

    Heredity

  • 2025/06

    Pita, S., Mora, P., Rico‐Porras, J.M., Cabral‐de‐Mello, D.C., Ruiz‐Ruano, F.J., Palomeque, T., Hieu, H.V., Panzera, F., Lorite, P.

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    A new piece in the repeatome puzzle of Triatominae bugs: The analysis of Triatoma rubrofasciata reveals the role of satellite DNAs in the karyotypic evolution of distinct lineages

    Insect Molecular Biology

  • 2025/05

    Dedukh, D., Malinovskaya, L., Kauzál, O., Rídl, J., Odnoprienko, D., Karamysheva, T., Vontzou, N., Janko, K., Suh, A., Albrecht, T., Torgasheva, A., Reifová, R.

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    Mechanisms and timing of programmed DNA elimination in songbirds

  • 2025/05

    Roussel, A., Suh, A., Ruiz-Ruano, F.J., Dion-Côté, A.

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    Accumulation of a biparentally-inherited Neptune transposable element in natural Killifish hybrids (Fundulus diaphanus × F. heteroclitus)

    bioRxiv

  • 2025/05

    Letsch, H., Greve, C., Hundsdoerfer, A.K., Irisarri, I., Moore, J.M., Espeland, M., Wanke, S., Arifin, U., Blom, M.P.K., Corrales, C., Donath, A., Fritz, U., Köhler, G., Kück, P., Lemer, S., Mengual, X., Salas, N.M., Meusemann, K., Palandačić, A., Printzen, C., Sigwart, J.D., Silva-Brandão, K.L., Simões, M., Stange, M., Suh, A., Szucsich, N., Tilic, E., Töpfer, T., Böhne, A., Janke, A., Pauls, S.

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    Type genomics: a framework for integrating genomic data into biodiversity and taxonomic research

    Systematic Biology, 6, 74

  • 2025/04

    Ahissa, L., Decher, J., Gazzard, A.

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    Wimmer’s Shrew - Crocidura wimmeri

  • 2025/04

    Decher, J., Schlitter, D., Adu-Tutu, P., Gazzard, A.

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    Baers’s Wood Mouse - Hylomyscus baeri

  • 2025/02

    Stefen, C., Jentke, T., Birkwald, T., Chmieleski, J., Decher, J., Kaus-Thiel, A., Morkel, C., Thielen, J., Goldberg, R., Jakobitz, J., Atzig, H., Müller, A., Krause, R., Fichter, E., Wolfram, E., Twietmeyer, S., Stuckas, H.

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    Large scale monitoring of terrestrial small mammals using noninvasive sampling and COI barcoding

    Mammal Research

  • 2025/02

    Monsen, O., Gronvold, L., Datsomor, A., Harvey, T.N., Kijas, J., Suh, A.S., Hvidsten, T.R., Sandve, S.R.

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    The role of transposon activity in shapingcis-regulatory element evolution after whole genome duplication

    Genome Research

  • 2025/01

    Jenike, K.M., Campos-Domínguez, L., Boddé, M., Cerca, J., Hodson, C.N., Schatz, M.C., Jaron, K.S.

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    k-mer approaches for biodiversity genomics

    Genome Research

  • 2025/01

    Vea, I.M., de la Filia, A.G., Jaron, K.S., Barlow, S.E.J., Herbette, M., Mongue, A.J., Nelson, R., Ruiz-Ruano, F.J., Ross, L.

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    The B Chromosome of Pseudococcus viburni: A Selfish Chromosome that Exploits Whole-Genome Meiotic Drive

    Genome Biology and Evolution, 1, 17

  • 2024

  • 2024/12

    Peona, V., Martelossi, J., Almojil, D., Bocharkina, J., Brännström, I., Brown, M., Cang, A., Carrasco-Valenzuela, T., DeVries, J., Doellman, M., Elsner, D., Espíndola-Hernández, P., Montoya, G.F., Gaspar, B., Zagorski, D., Hałakuc, P., Ivanovska, B., Laumer, C., Lehmann, R., Boštjančić, L.L., Mashoodh, R., Mazzoleni, S., Mouton, A., Nilsson, M.A., Pei, Y., Potente, G., Provataris, P., Pardos-Blas, J.R., Raut, R., Sbaffi, T., Schwarz, F., Stapley, J., Stevens, L., Sultana, N., Symonova, R., Tahami, M.S., Urzì, A., Yang, H., Yusuf, A., Pecoraro, C., Suh, A.

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    Teaching transposon classification as a means to crowd source the curation of repeat annotation – a tardigrade perspective

    Mobile DNA, 1, 15

Mitarbeitende

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