Metabarcoding, Bonn

| von

2026

• 2026/05

  Hollingsworth, P.M., Fantoni, K., Koureas, D., Arakelyan, M., Aravanopoulos, F.A., Bacela-Spychalska, K., Ballesteros-Mejia, L., Beja, P., Bonchev, G.N., Bou Dagher Kharrat, M., Bourlat, S.J., Chkhartishvili, T., Čiampor, F., Costa, F.O., Csabai, Z., Dankova, G., Ekrem, T., Emerson, B., Ferreira, S., Gadawski, P., Gkagkavouzis, K., Hebert, P.D.N., Ichim, M.C., Jelić, M., Kaitetzidou, E., Kalamujić Stroil, B., Kamenova, S., Keskin, E., Laini, A., Lawniczak, M., Madesis, P., Montagna, M., Mutanen, M., Peters, R.S., Price, B., Rewicz, T., Rougerie, R., Rulik, B., Szucsich, N., Vos, R., Goodall-Copestake, W.P., Triantafyllidis, A., Grabowski, M.

  Mehr anzeigen...

  Species identification, discovery, and biomonitoring: Strategic priorities for DNA barcoding in Europe, set in a global context

  BioScience

  https://doi.org/

• 2026/04

  Hartke, T.R., Wittenhorst, M., Koch, M., Scherber, C., Twietmeyer, S., Bourlat, S.J., Böhme, M., Kirse, A.

  Mehr anzeigen...

  Combining Time-Stamped Insect Sampling With eDNA-Metabarcoding of Guano to Reconstruct Community Interactions

  Ecology and Evolution, 4, 16

  https://doi.org/

• 2026/02

  Koureas, D., Beja, P., Blaxter, M., Böhne, A., Bourlat, S., Ekrem, T., Emerson, B., Heil, K., Melo-Ferreira, J., Price, B., Vos, R., Addink, W., Alioto, T., Aravanopoulos, F., Astrin, J., Aury, J., Barnes, I., Bruschini, C., Buzan, E., Cochrane, G., Cserkész, T., Dailianis, T., Duijm, E., Dunshea, G., Fernández, R., Ferreira, S., Formenti, G., Fratini, S., Gkagkavouzis, K., Goble, C., Grabowski, M., Grüning, B., Gut, I., Gut, M., Harrison, P., Hausmann, A., Höglund, J., Iacolina, L., Iannucci, A., Jakobsen, K., Kõljalg, U., Lantz, H., Lewin, H., Macher, J., Manousaki, T., Martin, F., Mengual, X., Oliveira, P., Oomen, R., Raupach, M., Riesgo, A., Roest Crollius, H., Somogyi, A., Struck, T., Svardal, H., Tooming-Klunderud, A., Triantafyllidis, A., Vinnere Pettersson, O., Wagner, M., Wincker, P., Yan, N., Alonso, J., Casino, A., Ciofi, C., Daňková, G., Hollingsworth, P., Lawniczak, M., Mazzoni, C., Waterhouse, R.

  Mehr anzeigen...

  Biodiversity Genomics Europe (BGE) Project – Abridged Grant Proposal

  Research Ideas and Outcomes, 12

  https://doi.org/

2025

• 2025/11

  Lehmitz, R., Hohberg, K., Husemann, M., Peters, R.S., Scheunemann, N., Bálint, M., Balke, M., Bieberich, J., Bista, I., Borsch, T., Bourlat, S.J., Bussmann, R.W., Damm, U., Dey, L., Flocco, C.G., Grossart, H., Haase, P., Höfer, H., Krashevska, V., Krogmann, L., Lücking, R., Arbizu, P.M., Meier, R., Mengual, X., Mercado-Salas, N.F., Moore, J.M., Orr, M.C., Otte, V., Overmann, J., Pauls, S.U., Pereira, R.J., Peters, J., Potapov, A., Printzen, C., Raub, F., Raupach, M.J., Rduch, V., Retter, A., von Reumont, B.M., Rossel, S., Schmelz, R.M., Schmitt, T., Scholler, M., Stolle, E., Thines, M., Vasilita, C., Wesener, T., Zahiri, R., Zaitsev, A., Zimmermann, J., Żyła, D., Misof, B., Tockner, K.

  Mehr anzeigen...

  Unknown Germany - An integrative biodiversity discovery program

  npj Biodiversity, 1, 4

  https://doi.org/

• 2025/09

  Corrales, C., Bacela-Spychalska, K., Buzan, E., Ekrem, T., Ferreira, S., Goodall-Copestake, W., Kloeke, E.v.O., Hollingsworth, M., Bourlat, S.J.

  Mehr anzeigen...

  The role of community science in DNA-based biodiversity monitoring

  Molecular Ecology, 19, 34

  https://doi.org/

• 2025/06

  Vos, R.A., Abarenkov, K., Agda, J., Agda, J., Altenburg, R., Bourlat, S.J., Brown, T., Chadwick, E., Cholley, P., Deister, F., Groenenberg, D., islam, S., Juty, N., Kadhirvelu, V.B., Kamouyiaros, M., Lowe, D., Merchant, H., Pauperio, J., Price, B.W., Ratnasingham, S., Soiland-Reyes, S., Staffoni, G., Wei, C., White, O., Koureas, d.

  Mehr anzeigen...

  Enhancing Digital Infrastructures and Data Handling Practices for Single Specimen Barcoding - the 2024 BGE Barcoding Hackathon

  https://doi.org/

• 2025/03

  Thomas, L.J., Zizka, V.M.A., Noll, N.W., Scherges, A.M., Posanski, M., Bourlat, S.J., Rulik, B., Mühlethaler, R., Lehmann, G.U.C., Koethe, S., Scherber, C., Schäffler, L.

  Mehr anzeigen...

  Identifying conservation hotspots and assessing species commonness and rarity: Baseline arthropod diversity in German nature reserves via national Malaise trap monitoring

  Insect Conservation and Diversity

  https://doi.org/

• 2025/01

  Kilian, I.C., Kirse, A., Peters, R.S., Bourlat, S.J., Fonseca, V.G., Wägele, W.J., Hamm, A., Mengual, X.

  Mehr anzeigen...

  Maximizing Identification Precision of Hymenoptera and Brachycera (Diptera) With a Non‐Destructive Metabarcoding Approach

  Ecology and Evolution, 1, 15

  https://doi.org/

• 2025/01

  Leidenberger, S., Wiese, V., Schaumann, F., Pleiss, F., Langen, K., Bourlat, S.J.

  Mehr anzeigen...

  Freshwater mollusc community screening - Classical and eDNA monitoring methods to detect rare, indicator and invasive species

  Science of the Total Environment, 958

  https://doi.org/

2024

• 2024/09

  Kilian, I.C., Neuhoff, D., Täufer, F., Nabel, M., Kirse, A., Bourlat, S.J., Döring, T.

  Mehr anzeigen...

  Der Einfluss von Bewirtschaftung und organischer Düngung auf Bodenarthropoden in ackerbaulich genutzten Böden

  0028-0615, 9-10, 99

• 2024/08

  Corrales-Duque, C., Bourlat, S.

  Mehr anzeigen...

  BGE Milestone MS 2.4b

• 2024/02

  Zizka, V., Langen, K., Kirse, A., Scherges, A., Bourlat, S.J.

  Mehr anzeigen...

  Non-destructive DNA extraction and metabarcoding of arthropod bulk samples: a step-by-step protocol

  https://doi.org/

• 2024/02

  Kirse, A., Paja, M., Reinhold, L., Bourlat, S., Wägele, W.

  Mehr anzeigen...

  Development of an automated Malaise trap multisampler

  https://doi.org/

2023

• 2023/11

  Sickel, W., Zizka, V., Scherges, A., Bourlat, S.J., Dieker, P.

  Mehr anzeigen...

  Abundance estimation with DNA metabarcoding–recent advancements for terrestrial arthropods

  Metabarcoding and Metagenomics, 7

  https://doi.org/

• 2023/07

  Chua, P.Y., Bourlat, S.J., Ferguson, C., Korlevic, P., Zhao, L., Ekrem, T., Meier, R., Lawniczak, M.K.

  Mehr anzeigen...

  Future of DNA-based insect monitoring

  Trends in Genetics, 7, 39

  https://doi.org/

• 2023/05

  Corrales-Duque, C., Bourlat, S.

  Mehr anzeigen...

  BGE Milestone MS2.4a

2022

• 2022/12

  Bourlat, S., Astrin, J.

  Mehr anzeigen...

  BGE Deliverable D4.2: Metadata standards

• 2022/08

  Grobe, P., Gemeinholzer, B., Kirse, A., Saeed, A., Bourlat, S.J.

  Mehr anzeigen...

  Data Flows for Metabarcoding-based Monitoring in the Project Automated Multisensor Stations for Monitoring of Biodiversity

  Biodiversity Information Science and Standards, 6

2021

• 2021/06

  Eriksson, B.K., Yanos, C., Bourlat, S.J., Donadi, S., Fontaine, M.C., Hansen, J.P., Jakubavičiūtė, E., Kiragosyan, K., Maan, M.E., Merilä, J., Austin, Å.N., Olsson, J., Reiss, K., Sundblad, G., Bergström, U., Eklöf, J.S.

  Mehr anzeigen...

  Habitat segregation of plate phenotypes in a rapidly expanding population of three‐spined stickleback

  Ecosphere, 6, 12

  https://doi.org/

• 2021/05

  Kirse, A., Bourlat, S.J., Langen, K., Fonseca, V.G.

  Mehr anzeigen...

  Unearthing the potential of soil eDNA metabarcoding—Towards best practice advice for invertebrate biodiversity assessment

  Frontiers in ecology and evolution, 9

  https://doi.org/

2020

• 2020/05

  Eriksson, B.K., Yanos, C., Bourlat, S., Donadi, S., Fontaine, M.C., Hansen, J.P., Jakubavičiūtė, E., Kiragosyan, K., Maan, M.E., Merilä, J., Austin, Å.N., Olsson, J., Reiss, K., Sundblad, G., Bergström, U., Eklöf, J.S.

  Mehr anzeigen...

  The rise of the three-spined stickleback–eco-evolutionary consequences of a mesopredator release

  bioRxiv

2019

• 2019/11

  Sundberg, P., Obst, M., Bourlat, S.J., Bergkvist, J., Magnusson, M.

  Mehr anzeigen...

  Utvärdering av ny övervakning av främmande arter: Metodjämförelse mellan traditionell och DNA-baserad identifiering

• 2019/06

  Leidenberger, S., Jonsson, A., Bourlat, S.

  Mehr anzeigen...

  End biodiversity loss through improved tracking of marine threatened invertebrates

2017

• 2017/04

  Holovachov, O., Haenel, Q., Bourlat, S.J., Jondelius, U.

  Mehr anzeigen...

  Taxonomy assignment approach determines the efficiency of identification of metabarcodes in marine nematodes

  arXiv preprint arXiv:1704.05412

  https://doi.org/

2016

• 2016/07

  Bourlat, S.J.

  Mehr anzeigen...

  Marine Genomics: Methods and Protocols

  1452

  https://doi.org/