zcb - LIB

Von Objekten zu Wissen

Naturkundemuseen entwickeln sich zu internationalen Zentren offenen Biodiversitätswissens. Am Leibniz-Institut zur Analyse des Biodiversitätswandels (LIB) wird dieser Wandel durch die Einrichtung des Zentrums für Biodiversitäts-Wissensforschung (zcb) vorangetrieben – ein bereichsübergreifendes Zentrum, das alle Forschungs- und Transferzentren des LIB verbindet.

Vision und Mission

Das Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung wird die Sammlungen und das Fachwissen des LIB in einen global zugänglichen Wissensraum überführen. Durch die Integration von Data Science, Künstlicher Intelligenz (KI) und Bürgerwissenschaften verbindet das Zentrum physische Objekte mit digitalem Wissen, um Biodiversität und deren Veränderungen verständlich und handlungsrelevant zu machen.

Strategische Ziele

Zukunftsorientierte, vernetzte Sammlungen aufbauen: Bis zu 100 % der Bestände des LIB digitalisieren, unterstützt durch KI, Robotik und FAIR-/CARE-konforme Datenstandards.
Biodiversitätsforschung mit Wirkung ermöglichen: Dateninfrastrukturen und KI-Tools entwickeln, um Biodiversitätsveränderungen zu überwachen, zu analysieren und vorherzusagen.
Den LIB-Wissensraum schaffen: Eine offene, semantisch webbasierte Plattform, die Forschungsdaten über Disziplinen hinweg verknüpft und Wissenschaftlern sowie der Öffentlichkeit zugänglich macht.

Kernbereiche

Datenmobilisierung – Digitalisierung, Datenintegration und Metadatenmanagement über alle LIB-Sammlungen hinweg.
Biodiversity Data Science – Entwicklung von KI-Modellen, semantischen Wissensgraphen und Analysetools für ökologische und genomische Daten.
Bürgerwissenschaft – Inklusive Beteiligung an der Biodiversitätsforschung durch gemeinschaftliche Datenerhebung, Validierung und Analyse.

Umsetzung und Governance

Standortübergreifende Zusammenarbeit zwischen den LIB-Standorten Bonn und Hamburg unter Einbeziehung aller Fachzentren.
Flache, partizipative Governance zur Förderung offener Diskussionen, agiler Entwicklung und gemeinsamer Entscheidungsfindung.
Rollen und Expertise: KI-Entwickler, Datenwissenschaftler, digitale Sammlungsmanager, Semantic-Web-Entwickler und strategische Forschende.

Ziele bis 2035

Durch systematische Digitalisierung, Vernetzung und Interpretation von Biodiversitätsdaten wird das Zentrum für Biodiversitäts-Datenwissenschaft:

Das LIB als global offenen Objekt- und Wissens-Hub positionieren.
Die Führungsrolle des LIB in Biodiversitätsinformatik und datengetriebener Naturschutzforschung stärken.
Innovation und gesellschaftliches Engagement durch transparente, partizipative Forschung fördern.

Dr. Lars Martin Vogt

Leitung Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung (zcb)

Tel.: +49 228 9122 342
E-Mail: l.vogt@leibniz-lib.de

Larissa Pape

Zentrumsassistenz

Tel.: +49 228 9122 358
Fax: +49 228 9122 212
E-Mail: l.pape@leibniz-lib.de

Projekte

Alle Projekte

LEPMON: Erfassung der Biodiversität von Nachtfaltern (Lepidoptera) mit KI
Leitung: Dr. Peter Grobe
Unbekanntes Deutschland
NFDI4Biodiversity
Leitung: Dr. Peter Grobe
CaBOL - Caucasus Barcode of Life
Leitung: Prof. Dr. Bernhard Misof
FOGS
Leitung: Dr. Jonas Astrin
1KITE
Leitung: Prof. Dr. Bernhard Misof
GGBN
Leitung: Dr. Jonas Astrin
GGBC
Leitung: Prof. Dr. Bernhard Misof

Publikationen

| von

2025

2025/09
Vogt, L., Mons, B.
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The Grammar of FAIR: A Granular Architecture of Semantic Units for FAIR Semantics, Inspired by Biology and Linguistics
2025/09
Alamenciak, T., Arnillas, C.A., Caufield, J.H., Compton, K., DREW, K.M., Frühstückl, R., Heger, T., König‐Ries, B., Mungall, C., Moxon, S., Reese, J., Tardif, J., Vogt, L.
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Ecolink: Towards a Knowledge Graph Schema for Complex Environmental Systems
2025/08
Vogt, L., König‐Ries, B., Alamenciak, T., Brian, J.I., Arnillas, C.A., Korell, L., Frühstückl, R., Heger, T.
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A Framework for FAIR and CLEAR Ecological Data and Knowledge: Semantic Units for Synthesis and Causal Modelling
2025/04
Vogt, L., Strömert, P., Matentzoglu, N., Karam, N., Konrad, M., Prinz, M., Baum, R.
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Suggestions for extending the FAIR Principles based on a linguistic perspective on semantic interoperability
Scientific data, 1, 12
2025/03
Biniossek, C., Betz, D., Vogt, L., Stocker, M.
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Towards Machine-Actionable Scientific Knowledge as FAIR Digital Objects
2025/03
Ahrens, D., Haas, A., Pacheco, T.L., Grobe, P.
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Extracting specimen label data rapidly with a smartphone—a great help for simple digitization in taxonomy and collection management
ZooKeys, 1233
2025/03
Moore, J., Garilao, C., Kerbl, A.
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An annotated catalog of Annelida types at the Museum of Nature Hamburg, Zoology. Part I: Annelida: Errantia: Aciculata: Eunicida, Myzostomida, Aciculata incertae sedis, and Errantia: Protodriliformia
Evolutionary Systematics, 1, 9
2025/01
Mozer, A., Di‐Nizo, C.B., Consul, A., Huettel, B., Jäger, R., Akintayo, A., Erhardt, C., Fenner, L., Fischer, D., Forat, S., Gimnich, F., Grobe, P., Martin, S., Nathan, V., Saeed, A., von der Mark, L., Woehle, C., Olek, K., Misof, B., Astrin, J.J.
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FOGS: A SNPSTR Marker Database to Combat Wildlife Trafficking and a Cell Culture Bank for Ex‐Situ Conservation
Molecular Ecology resources

2024

2024/10
Bräunig, C., Meid, S., Quast, B., Rduch, V., Grobe, P.
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The ASV Registry: a place for ASVs to be
Metabarcoding and Metagenomics, 8
2024/09
Ruff, M., Wellsow, J., Weiss, M., Rach, B., Triebel, D.
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4 Datenmanagement – 4.3 Management von Vorkommensdaten, Umfang und Herkunft der Datenbestände
2024/07
Vogt, L., Konrad, M., Farfar, K.E., Prinz, M., Oelen, A., Prinz, M., Stroemert, P.
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Rosetta Statements: Simplifying FAIR Knowledge Graph Construction with a User-Centered Approach
2024/07
Vogt, L.
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Rethinking OWL Expressivity: Semantic Units for FAIR and Cognitively Interoperable Knowledge Graphs Why OWLs don't have to understand everything they say
2024/05
Vogt, L., Strömert, P., Matentzoglu, N., Karam, N., Konrad, M., Prinz, M., Baum, R.
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FAIR 2.0: Extending the FAIR Guiding Principles to Address Semantic Interoperability
2024/01
Rani, F.A., Wang, X., Charania, Z., Vogt, L., Urbas, L.
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Scalable data pipeline: Ontology-based OPC UA data access for the industrial internet of things

2023

2023/11
Vogt, L.
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FAIR Knowledge Graphs with Semantic Units: a Prototype
2023/11
Bernard‐Verdier, M., Heger, T., Mietchen, D., Musseau, C., Brinner, M., Hillig, A., Kraker, P., Lokatis, S., Nunes, A.L., Scheidweiler, N., Stocker, M., Vial, R., Vogt, L., Bacher, S., Baklouti, E., Gupta, H.B., Beisel, J., Bertolino, S., Briski, E., Castellanos‐Galindo, G.A., Courchamp, F., Daly, E., Dawson, W., Dickey, J.W.E., Evans, T., Itescu, Y., König‐Ries, B., Kumar, L., Kumschick, S., Meyerson, L.A., Pattison, Z., Pfadenhauer, W.G., Renault, D., Rickowski, F., Ruland, F., Schittko, C., Straka, T.M., Yannelli, F.A., Jeschke, J.M.
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Building an atlas of knowledge for invasion biology and beyond! 2nd enKORE-INAS Workshop
Research Ideas and Outcomes, 9
2023/10
Spanke, T., Gabelaia, M., Flury, J.M., Hilgers, L., Wantania, L.L., Misof, B., Wipfler‍, B., Wowor, D., Mokodongan, D.F., Herder, F., Schwarzer, J.
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A landmark‐free analysis of the pelvic girdle in Sulawesi ricefishes (Adrianichthyidae): How 2D and 3D geometric morphometrics can complement each other in the analysis of a complex structure
Ecology and Evolution, 10, 13
2023/08
Flury, J.M., Meusemann, K., Martin, S., Hilgers, L., Spanke, T., Böhne, A., Herder, F., Mokodongan, D.F., Altmüller, J., Wowor, D., Misof, B., Nolte, A.W., Schwarzer, J.
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Potential contribution of ancient introgression to the evolution of a derived reproductive strategy in ricefishes
Genome biology and evolution, 8, 15
2023/07
David, R., Baumann, K., Le Franc, Y., Magagna, B., Vogt, L., Widmann, H., Jouneau, T., Koivula, H., Madon, B., Åkerström, W.N., Ojsteršek, M., Scharnhorst, A., Schubert, C., Shi, Z., Tanca, L., Vancauwenbergh, S.
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Converging on a Semantic Interoperability Framework for the European Data Space for Science, Research and Innovation (EOSC)
2023/07
Vogt, L., Konrad, M., Prinz, M.
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Towards a Rosetta Stone for (meta)data: Learning from natural language to improve semantic and cognitive interoperability
2023/06
Nöske, N., Bräunig, C.
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Das FörTax-Datenportal ist online - „Taxonomische Bildungsangebote auf einen Blick“ bundesweit verfügbar
2023/04
Vogt, L., Konrad, M., Prinz, M.
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Knowledge Graph Building Blocks: An easy-to-use Framework for developing FAIREr Knowledge Graphs
2023/04
Girón, J.C., Tarasov, S., Montaña, L.A.G., Matentzoglu, N., Smith, A.D., Koch, M., Boudinot, B.E., Bouchard, P., Burks, R.A., Vogt, L., Yoder, M., Osumi-Sutherland, D., Friedrich, F., Beutel, R.G., Mikó, I.
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Formalizing Invertebrate Morphological Data: A Descriptive Model for Cuticle-Based Skeleto-Muscular Systems, an Ontology for Insect Anatomy, and their Potential Applications in Biodiversity Research and Informatics
Systematic Biology, 5, 72
2023/01
Vogt, L.
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The FAIREr Guiding Principles: Organizing data and metadata into semantically meaningful types of FAIR Digital Objects to increase their human explorability and cognitive interoperability
2023/01
Vogt, L., Kuhn, T., Hoehndorf, R.
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Semantic Units: Organizing knowledge graphs into semantically meaningful units of representation

Mitarbeitende

Alle Mitarbeitende

Christian Bräunig
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
E-Mail: c.braeunig@leibniz-lib.de
Sheikh Mastura Farzana
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
E-Mail: F.SheikhMastura@leibniz-lib.de
Cristina Therese Garilao
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Hamburg Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
Tel.: +49 40 238317 707
E-Mail: c.garilao@leibniz-lib.de
Dipl. Biol. Katharina Geiger
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb ztm Lepidoptera & Trichoptera
Tel.: +49 228 9122 411
E-Mail: k.geiger@leibniz-lib.de
Carina Goretzky
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
E-Mail: c.goretzky@leibniz-lib.de
Dr. Peter Grobe
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
Tel.: +49 228 9122 342
E-Mail: p.grobe@leibniz-lib.de
Larissa Pape
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb zbm Verwaltungsangestellte / Verwaltungsangestellter
Tel.: +49 228 9122 358
E-Mail: l.pape@leibniz-lib.de
Dr. Björn Quast
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
Tel.: +49 228 9122 347
E-Mail: b.quast@leibniz-lib.de
Dipl. Biol. Birgit Rach
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
Tel.: +49 228 9122 422
E-Mail: b.rach@leibniz-lib.de
Dr. Tobias Spanke
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb ztm Postdoktorandin / Postdoktorand
Tel.: +49 228 9122 411
E-Mail: t.spanke@leibniz-lib.de
Dr. Lars Martin Vogt
Zentrum für Biodiversitäts-Wissensforschung l zcb Hamburg Wissenschaftlerin / Wissenschaftler
Tel.: +49 228 9122 342
E-Mail: l.vogt@leibniz-lib.de