Dr. Iker Irisarri

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2025

• 2025/05

  Letsch, H., Greve, C., Hundsdoerfer, A.K., Irisarri, I., Moore, J.M., Espeland, M., Wanke, S., Arifin, U., Blom, M.P.K., Corrales, C., Donath, A., Fritz, U., Köhler, G., Kück, P., Lemer, S., Mengual, X., Salas, N.M., Meusemann, K., Palandačić, A., Printzen, C., Sigwart, J.D., Silva-Brandão, K.L., Simões, M., Stange, M., Suh, A., Szucsich, N., Tilic, E., Töpfer, T., Böhne, A., Janke, A., Pauls, S.

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  Type genomics: a Framework for integrating Genomic Data into Biodiversity and Taxonomic research

  Systematic Biology

  https://doi.org/

• 2025/02

  Rieseberg, T.P., Dadras, A., Darienko, T., Post, S., Herrfurth, C., Fürst-Jansen, J.M.R., Hohnhorst, N., Petroll, R., Rensing, S.A., Pröschold, T., de Vries, S., Irisarri, I., Feussner, I., de Vries, J.

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  Time-resolved oxidative signal convergence across the algae–embryophyte divide

  Nature communications, 1, 16

  https://doi.org/

• 2025/01

  Schafran, P., Hauser, D.A., Nelson, J.M., Xu, X., Mueller, L.A., Kulshrestha, S., Smalley, I., de Vries, S., Irisarri, I., de Vries, J., Davies, K., Villarreal, J.C.A., Li, F.

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  Pan-phylum genomes of hornworts reveal conserved autosomes but dynamic accessory and sex chromosomes

  Nature Plants

  https://doi.org/

2024

• 2024/09

  Zegers, J.M.S., Irisarri, I., de Vries, S., de Vries, J.

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  Evolving circuitries in plant signaling cascades.

  Journal of Cell Science, 17, 137

  https://doi.org/

• 2024/08

  Vences, M., Sachs, M., Irisarri, I., Bartels, F., Eriksson, P.F., Künzel, S., Kurabayashi, A., Laugen, A.T., Vegso, Z.T., Bishop, C.D., Kerney, R., Arndt, H.

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  Phylotranscriptomic relationships of the Oophila clade of green algae associated to amphibian egg masses

  Molecular Phylogenetics and Evolution

  https://doi.org/

• 2024/08

  Karbstein, K., Kösters, L., Hodač, L., Hofmann, M., Hörandl, E., Tomasello, S., Wagner, N.D., Emerson, B.C., Albach, D.C., Scheu, S., Bradler, S., de Vries, J., Irisarri, I., Li, H., Soltis, P., Mäder, P., Wäldchen, J.

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  Species delimitation 4.0: integrative taxonomy meets artificial intelligence

  Trends in ecology & evolution, 8, 39

  https://doi.org/

• 2024/08

  Schartl, M., Woltering, J.M., Irisarri, I., Du, K., Kneitz, S., Pippel, M., Brown, T., Franchini, P., Li, J., Li, M., Adolfi, M., Winkler, S., de Freitas Sousa, J., Chen, Z., Jacinto, S., Kvon, E.Z., Correa de Oliveira, L.R., Monteiro, E., Baia Amaral, D., Burmester, T., Chalopin, D., Suh, A., Myers, E., Simakov, O., Schneider, I., Meyer, A.

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  The genomes of all lungfish inform on genome expansion and tetrapod evolution

  Nature

  https://doi.org/

• 2024/07

  Irisarri, I., Lorente-Martínez, H., Strassert, J.F.H., Agorreta, A., Zardoya, R., San Mauro, D., de Vries, J.

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  Early diversification of membrane intrinsic proteins (MIPs) in eukaryotes

  Genome biology and evolution

  https://doi.org/

• 2024/07

  Dhabalia Ashok, A., de Vries, S., Darienko, T., Irisarri, I., de Vries, J.

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  Evolutionary assembly of the plant terrestrialization toolkit from protein domains

  Proceedings - Royal Society. Biological sciences/Proceedings - Royal Society. Biological Sciences, 2027, 291

  https://doi.org/

2023

• 2023/12

  Hernández-Gómez, A., Irisarri, I., Fernández-Justel, D., Peláez, R., Jiménez, A., Revuelta, J.L., Balsera, M., Buey, R.M.

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  GuaB3, an overlooked enzyme in cyanobacteria's toolbox that sheds light on IMP dehydrogenase evolution

  Structure, 12, 31

  https://doi.org/

• 2023/11

  Rieseberg, T.P., Dadras, A., Bergschmidt, L.I.N., Bierenbroodspot, M.J., Fürst‐Jansen, J.M.R., Irisarri, I., de Vries, S., Darienko, T., de Vries, J.

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  Divergent responses in desiccation experiments in two ecophysiologically different Zygnematophyceae

  Physiologia Plantarum, 6, 175

  https://doi.org/

• 2023/07

  Theissinger, K., Fernandes, C., Formenti, G., Bista, I., Berg, P.R., Bleidorn, C., Bombarely, A., Crottini, A., Gallo, G.R., Godoy, J.A., Jentoft, S., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R.A., Paez, S., Palsbøll, P.J., Pampoulie, C., Ruiz-López, M.J., Secomandi, S., Svardal, H., Theofanopoulou, C., Vries, J.D., Waldvogel, A., Zhang, G., Jarvis, E.D., Bálint, M., Ciofi, C., Waterhouse, R.M., Mazzoni, C.J., Höglund, J., Aghayan, S.A., Alioto, T.S., Almudi, I., Alvarez, N., Alves, P.C., Rosario, I.R.A.d., Antunes, A., Arribas, P., Baldrian, P., Bertorelle, G., Böhne, A., Bonisoli-Alquati, A., Boštjančić, L.L., Boussau, B., Breton, C.M., Buzan, E., Campos, P.F., Carreras, C., Castro, L.F.C., Chueca, L.J., Čiampor, F., Conti, E., Cook-Deegan, R., Croll, D., Cunha, M.V., Delsuc, F., Dennis, A.B., Dimitrov, D., Faria, R., Favre, A., Fedrigo, O.D., Fernández, R., Ficetola, G.F., Flot, J., Gabaldón, T., Agius, D.R., Giani, A.M., Gilbert, M.T.P., Grebenc, T., Guschanski, K., Guyot, R., Hausdorf, B., Hawlitschek, O., Heintzman, P.D., Heinze, B., Hiller, M., Husemann, M., Iannucci, A., Irisarri, I., Jakobsen, K.S., Klinga, P., Kloch, A., Kratochwil, C.F., Kusche, H., Layton, K.K., Leonard, J.A., Lerat, E., Liti, G., Manousaki, T., Marques-Bonet, T., Matos-Maraví, P., Matschiner, M., Maumus, F., Cartney, A.M.M., Meiri, S., Melo-Ferreira, J., Mengual, X., Monaghan, M.T., Montagna, M., Mysłajek, R.W., Neiber, M.T., Nicolas, V., Novo, M., Ozretić, P., Palero, F., Pârvulescu, L., Pascual, M., Paulo, O.S., Pavlek, M., Pegueroles, C., Pellissier, L., Pesole, G., Primmer, C.R., Riesgo, A., Rüber, L., Rubolini, D., Salvi, D., Seehausen, O., Seidel, M., Studer, B., Theodoridis, S., Thines, M., Urban, L., Vasemägi, A., Vella, A., Vella, N., Vernes, S.C., Vernesi, C., Vieites, D.R., Wheat, C.W., Wörheide, G., Wurm, Y., Zammit, G.

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  How genomics can help biodiversity conservation

  Trends in Genetics, 7, 39

• 2023/06

  Lorente-Martínez, H., Agorreta, A., Irisarri, I., Zardoya, R., Edwards, S.V., San Mauro, D.

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  Multiple Instances of Adaptive Evolution in Aquaporins of Amphibious Fishes

  Biology, 6, 12

  https://doi.org/

2022

• 2022/03

  Formenti, G., Theißinger, K., Fernandes, C., Bista, I., Bombarely, A., Bleidorn, C., Ciofi, C., Crottini, A., Godoy, J.A., Höglund, ‎., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R.A., Paez, S., Palsbøll, P.J., Pampoulie, C., Ruiz‐López, M.J., Svardal, H., Theofanopoulou, C., de Vries, J., Waldvogel, A., Zhang, G., Mazzoni, C.J., Jarvis, E.D., Bálint, M., Formenti, G., Theißinger, K., Fernandes, C., Bista, I., Bombarely, A., Bleidorn, C., Čiampor, F., Ciofi, C., Crottini, A., Godoy, J.A., Höglund, ‎., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R.A., Paez, S., Palsbøll, P.J., Pampoulie, C., Ruiz‐López, M.J., Svardal, H., Theofanopoulou, C., de Vries, J., Waldvogel, A., Guojie, Z., Mazzoni, C.J., Jarvis, E.D., Bálint, M., Aghayan, S.A., Alioto, T., Almudí, I., Álvarez, N., Alves, P.C., Amorim, I.R., Antunes, A., Arribas, P., Baldrián, P., Berg, P.R., Bertorelle, G., Böhne, A., Bonisoli‐Alquati, A., Boštjančić, L.L., Boussau, B., Breton, C., Bužan, E., Campos, P.F., Carreras, C., Castro, L.F.C., Chueca, L.J., Conti, E., Cook‐Deegan, R., Croll, D., Cunha, M.V., Delsuc, F., Dennis, A.B., Dimitrov, D., Faria, R., Favre, A., Fédrigo, O., Fernández, R., Ficetola, G.F., Flot, J., Gabaldón, T., Agius, D., Gallo, G.R., Giani, A.M., Gilbert, M.T.P., Grebenc, T., Guschanski, K., Guyot, R., Hausdorf, B., Hawlitschek, O., Heintzman, P.D., Heinze, B., Hiller, M., Husemann, M., Iannucci, A., Irisarri, I., Jakobsen, K.S., Jentoft, S., Klinga, P., Kloch, A., Kratochwil, C.F., Kusche, H., Layton, K.K.S., Leonard, J.A., Lerat, E., Liti, G., Manousaki, T., Marquès‐Bonet, T., Matos‐Maraví, P., Matschiner, M., Maumus, F., Mc Cartney, A.M., Meiri, S., Melo‐Ferreira, J., Mengual, X., Monaghan, M.T., Montagna, M., Mysłajek, R.W., Neiber, M.T., Nicolas, V., Novo, M., Ozretić, P., Palero, F., Pârvulescu, L., Pascual, M., Paulo, O.S., Pavlek, M., Pegueroles, C., Pellissier, L., Pesole, G., Primmer, C.R., Riesgo, A., Rüber, L., Rubolini, D., Salvi, D., Seehausen, O., Seidel, M., Secomandi, S., Studer, B., Theodoridis, S., Thines, M., Urban, L., Vasemägi, A., Vella, A., Vella, N., Vernes, S.C., Vernesi, C., Vieites, D.R., Waterhouse, R.M., Wheat, C.W., Wörheide, G., Wurm, Y., Zammit, G.

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  The era of reference genomes in conservation genomics

  Trends in Ecology & Evolution, 3, 37

  https://doi.org/