Prof. Dr. Alexander Suh

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2026

• 2026/08

  Formenti, G., Jain, N., Medico, J.A., Sollitto, M., Antipov, D., Barcellos, S., Biegler, M., Borges, I., Chang, J.K., Chen, Y., Cheng, H., da Conceição, H.B., Davenport, M., De Oliveira, L., Duarte, E., Durham, G., Fenn, J., Forde, N., Galante, P.A., Gerhardt, K., Giani, A.M., Giunta, S., Kim, J., Komissarov, A., Koo, B., Koren, S., Larkin, D., Lee, C., Li, H., Makova, K.D., Masterson, P., Murphy, T., McCaffrey, K., Mercuri, R.L.V., Na, Y., O’Connell, M.J., Ou, S., Phillippy, A.M., Popova, M., Rhie, A., Ruiz-Ruano, F.J., Secomandi, S., Smeds, L., Suh, A., Tilley, T., Vontzou, N., Waters, P.D., Balacco, J., Jarvis, E.D.

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  The complete genome of a songbird

  Cell, 16, 189

  https://doi.org/

• 2026/05

  Uliano-Silva, M., da Conceição, H.B., Mercuri, R.L.V., Winkler, S., Guardia, G.D.A., Myers, E., McCarthy, S., Tracey, A., Suh, A., Blaxter, M., Galante, P.A.F., Mazzoni, C.J.

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  Elevated retrocopy burden and sloth-specific expansions illuminate mammalian genome evolution

  BMC Biology

  https://doi.org/

• 2026/05

  Nuriddinov, M., Malinovskaya, L., Bobrovskikh, A., Gridina, M., Serdyukova, N.A., Suh, A., Ruiz-Ruano, F.J., Torgasheva, A.

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  Chromosome-level genome assembly of the sand martin (Riparia riparia)

  Scientific data

  https://doi.org/

• 2026/04

  Kück, P., Suh, A.

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  Persistent conflict in palaeognath phylogeny revealed by quartet-based and ML analyses

  Frontiers in Zoology

  https://doi.org/

• 2026/03

  Chen, A., Ruiz-Ruano, F.J., Contreras-López, O., Fouché, S., Suh, A., Pei, Y.

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  Paralog-aware assembly and filtering strategies reveal minimal nucleotide variation on the macro germline-restricted chromosome of the zebra finch

  Heredity

  https://doi.org/

2025

• 2025/12

  Vontzou, N., Pei, Y., Campo-Bes, I., Forstmeier, W., Hertel, M., Irimia, M., Kempenaers, B., Kuhn, S., Martin, K., Mueller, J.C., Teltscher, K., Mollbrink, A., Abalo, X., Biegler, M.T., Immler, S., Ruiz-Ruano, F.J., Suh, A.S.

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  The germline-restricted chromosome orchestrates germ cell development in passerine birds

  https://doi.org/

• 2025/10

  Lutgen, D., Peona, V., Chase, M.A., Kakhki, N.A., Lammers, F., de Souza, S.G., Ducrest, A., Burri, M., Andriopoulos, P., Lukhele, S.M., Moysi, M., Yohannes, E., Abbasov, A., Albayrak, T., Aliabadian, M., Auchli, N., Bontzorlos, V., Christoforou, I., Copete, J.L., Fulco, E., Garcia, J.T., Javakhishvili, Z., Kazazou, A., Lei, F., Liu, Y., Paposhvili, N., Patchett, R., Péter, Á., Ritter, R., Sándor, A.D., Schneider, F., Shurulinkov, P., Sklyarenko, S., Stumberger, B., Tagiyev, A., Uboldi, A., Vogiatzis, N., Taborsak-Lines, F., Gruselius, J., Yao, L., Peichel, C.L., Suh, A., Gagnaire, P., Kirschel, A.N.G., Schweizer, M., Schielzeth, H., Burri, R.

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  A mosaic of modular variation at a single gene underpins convergent plumage coloration

  Science, 6770, 390

  https://doi.org/

• 2025/10

  Pei, Y., Forstmeier, W., Suh, A., Bambach, L., Borges, I., Low, G.W., Dion-Côté, A., Knief, U., Wolf, J., Kempenaers, B.

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  Evolution of large polymorphic inversions in a panmictic songbird

  Molecular Biology and Evolution

  https://doi.org/

• 2025/10

  Roussel, A., Suh, A., Ruiz-Ruano, F.J., Dion-Côté, A.

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  Accumulation of a biparentally-inherited Neptune transposable element in natural Killifish hybrids (Fundulus diaphanus × F. heteroclitus)

  Molecular Biology and Evolution

  https://doi.org/

• 2025/10

  Palacios-Gimenez, O.M., Varma, M., Cheng, X., Mosbech, M., Suh, A., Schielzeth, H.

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  Chromosome-level assembly of the club-legged grasshopper (Gomphocerus sibiricus) genome

  G3

  https://doi.org/

• 2025/07

  Ruiz-Ruano, F.J., Schlebusch, S.A., Vontzou, N., Moreno, H., Biegler, M.T., Kutschera, V.E., Ekman, D., Borges, I., Pei, Y., Rossini, R., Albrecht, T., Boman, J., Borodin, P., Burri, R., Cain, K.E., Forstmeier, W., Frankl-Vilches, C., Gahr, M., Griffith, S.C., Hill, A.M., Irestedt, M., Joseph, L., Jønsson, K.A., Kawakami, T., Kempenaers, B., Malinovskaya, L., Mueller, J.C., Oliveira, E.H.C.d., Palacios-Gimenez, O.M., Palinauskas, V., Qvarnström, A., Reifova, R., Ridl, J., Segami, J.C., Tan, D.J.X., Torgasheva, A., Whibley, A., Suh, A.S.

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  Programmed DNA elimination drives rapid genomic innovation in two thirds of all bird species

  bioRxiv

  https://doi.org/

• 2025/07

  Rídl, J., Dedukh, D., Halenková, Z., Schlebusch, S.A., Beneš, V., Lopez, M.O., Osiejuk, T.S., Ruiz-Ruano, F.J., Suh, A., Albrecht, T., Reif, J., Reifová, R.

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  Germline-restricted chromosome of songbirds has different centromere compared to regular chromosomes

  Heredity

  https://doi.org/

• 2025/05

  Dedukh, D., Malinovskaya, L., Kauzál, O., Rídl, J., Odnoprienko, D., Karamysheva, T., Vontzou, N., Janko, K., Suh, A., Albrecht, T., Torgasheva, A., Reifová, R.

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  Mechanisms and timing of programmed DNA elimination in songbirds

  https://doi.org/

• 2025/05

  Roussel, A., Suh, A., Ruiz-Ruano, F.J., Dion-Côté, A.

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  Accumulation of a biparentally-inherited Neptune transposable element in natural Killifish hybrids (Fundulus diaphanus × F. heteroclitus)

  bioRxiv

• 2025/05

  Letsch, H., Greve, C., Hundsdoerfer, A.K., Irisarri, I., Moore, J.M., Espeland, M., Wanke, S., Arifin, U., Blom, M.P.K., Corrales, C., Donath, A., Fritz, U., Köhler, G., Kück, P., Lemer, S., Mengual, X., Salas, N.M., Meusemann, K., Palandačić, A., Printzen, C., Sigwart, J.D., Silva-Brandão, K.L., Simões, M., Stange, M., Suh, A., Szucsich, N., Tilic, E., Töpfer, T., Böhne, A., Janke, A., Pauls, S.

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  Type genomics: a framework for integrating genomic data into biodiversity and taxonomic research

  Systematic Biology, 6, 74

  https://doi.org/

• 2025/02

  Monsen, O., Gronvold, L., Datsomor, A., Harvey, T.N., Kijas, J., Suh, A.S., Hvidsten, T.R., Sandve, S.R.

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  The role of transposon activity in shapingcis-regulatory element evolution after whole genome duplication

  Genome Research

  https://doi.org/

2024

• 2024/12

  Li, X., Jayaprasad, S., Einarsdottir, E., Cooper, S.J.B., Suh, A., Kawakami, T., Palacios-Gimenez, O.M.

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  Chromosome-level genome assembly of the morabine grasshopper Vandiemenella viatica19

  Scientific data, 1, 11

  https://doi.org/

• 2024/09

  Thörn, F., Soares, A.E.R., Müller, I.A., Päckert, M., Frahnert, S., van Grouw, H., Kamminga, P., Peona, V., Suh, A., Blom, M.P.K., Irestedt, M.

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  Contemporary intergeneric hybridization and backcrossing among birds-of-paradise

  Evolution Letters, 5, 8

  https://doi.org/

• 2024/08

  Schartl, M., Woltering, J.M., Irisarri, I., Du, K., Kneitz, S., Pippel, M., Brown, T., Franchini, P., Li, J., Li, M., Adolfi, M., Winkler, S., de Freitas Sousa, J., Chen, Z., Jacinto, S., Kvon, E.Z., Correa de Oliveira, L.R., Monteiro, E., Baia Amaral, D., Burmester, T., Chalopin, D., Suh, A., Myers, E., Simakov, O., Schneider, I., Meyer, A.

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  The genomes of all lungfish inform on genome expansion and tetrapod evolution

  Nature

  https://doi.org/

2023

• 2023/12

  Vontzou, N., Pei, Y., Mueller, J.C., Reifová, R., Ruiz-Ruano, F.J., Schlebusch, S.A., Suh, A.S.

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  Songbird germline-restricted chromosome as a potential arena of genetic conflicts

  Current Opinion in Genetics & Development, 83

2022

• 2022/09

  Borodin, P., Chen, A., Forstmeier, W., Fouché, S., Malinovskaya, L., Pei, Y., Reifová, R., Ruiz-Ruano, F.J., Schlebusch, S.A., Sotelo-Muñoz, M., Torgasheva, A., Vontzou, N., Suh, A.S.

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  Mendelian nightmares: the germline-restricted chromosome of songbirds

  Chromosome Research, 2, 30

  https://doi.org/